學院以“教學.教輔單位”、“黨群.行政單位”為主體。教學與行政分開的組織結構機構模式。
教學.教輔單位下設置：財經學院、管理學院、機電學院、建築工程學院、圖書館、思政部......15個教學.教輔單位。
黨群.行政單位下設置：黨委辦公室、紀委辦公室、學校辦公室、教務處、學生處、財務處........16個黨群.行政單位 。 根據2014年9月學校官網顯示，該校下設9個二級院系，***有33個專科專業。
學校以高等職業技術教育為主，設有財經學院、管理學院、機電工程學院、建築工程學院、人文社科學院、外語外貿學院、信息工程學院、藝術設計學院、珠寶學院、思想政治理論課教研部等九院壹部，開設47個緊貼珠三角地區產業結構和社會發展需求的專業。
至今為止，學校擁有玩具設計與制造、計算機網絡技術、金融管理與實務、裝潢藝術設計、酒店管理、珠寶首飾工藝及鑒定等6個國家示範性高職院校重點建設專業、9個省級示範性專業和6個市級示範性專業
專業設置 學院 專業名稱 學制 信息工程學院 計算機應用技術 3 計算機網絡技術 3 軟件技術 3 信息安全技術 3 嵌入式技術與應用（物聯網技術與應用） 3 珠寶學院 珠寶首飾工藝及鑒定 3 珠寶鑒定與營銷 3 管理學院 工商管理類 3 財經學院 會計電算化 3 審計實務（註冊會計師） 3 財政金融類 3 人文社科學院 文秘 3 社會工作 3 外語外貿學院 商務英語 3 商務日語 3 應用英語（國際會展） 3 國際商務 3 建築工程學院 土建施工類 3 建築設計技術 3 機電工程學院 數控技術 3 玩具設計與制造（玩具質量檢驗與管理） 3 模具設計與制造 3 汽車技術服務與營銷 3 應用電子技術 3 汽車檢測與維修技術 3 電氣自動化技術 3 機械制造與自動化 3 藝術設計學院 裝潢藝術設計 3藝術設計（時尚飾品設計、環境藝術設計）3產品造型設計3人物形象設計3影視動畫 3皮具設計3 學校面向全國公開招聘優秀教師，擁有壹支人員精幹、結構合理、水平較高的師資隊伍。現有教職工810余人，專任教師中具有高級職稱者占28.61%，青年教師中58%以上具有博士、碩士研究生學歷，專任教師中大部分具有“雙師”素質和相關專業資格證書。現有全國教育系統先進集體1個、全國職業教育先進單位1個、國家級教學團隊2個，有享受國務院政府特殊津貼專家3人、“國家高層次人才特殊支持計劃”教學名師1人、國家級高校教學名師2人、廣東省高校教學名師7人、廣州市高校教學名師6人。2000年以來，我校教師以學校為第壹署名出版的著作***290部，其中“十壹五”國家規劃教材21部。特殊津貼專家：張來源 、吳翰聲
國家高層次人才特殊支持計劃教學名師：渠川鈺
國家級教學名師：關俊良、張來源
省級教學名師：關俊良、渠川鈺、闞雅玲、王昶、張來源、賀平、曹幹
廣州市高校教學名師：盧飛躍、袁軍平 、楊則文、余明輝、曹幹、賀平
國家級教學團隊：玩具設計與制造專業教學團隊（渠川鈺） 、裝潢藝術設計專業教學團隊（張來源） 質量工程
根據2014年9月學校官網顯示，學校擁有全國教育系統先進集體1個、全國職業教育先進單位1個、6個國家示範性高職院校重點建設專業、9個省級示範性專業和6個市級示範性專業；15門國家級精品課程、21門省級精品課程和40門市級精品課程；14門國家級精品資源***享課程、2門省級精品資源***享課程和2門省級精品視頻公開課程；1個國家級校內實訓基地 、2個省級校內實訓基地和2個省級校外實訓基地。
全國教育系統先進集體：廣州番禺職業技術學院藝術設計學院
全國職業教育先進單位：廣州番禺職業技術學院珠寶學院
國家級校內實訓基地：數控技術實訓基地
省級校內實訓基地：玩具設計與制造實訓基地、珠寶鑒定及加工實訓基地
省級校外實訓基地：創業產業園實訓基地、玩具專業實訓基地、汽車專業實訓基地
國家示範性高職院校重點建設專業：玩具設計與制造、計算機網絡技術、金融管理與實務、裝潢藝術設計、酒店管理、珠寶首飾工藝及鑒定
省級示範性專業：金融管理與實務、會計電算化、玩具設計與制造、模具設計與制造、酒店管理、計算機網絡技術、商務英語、裝潢藝術設計 、珠寶首飾工藝及鑒定
國家級精品資源***享課程：《包裝設計》、《保險實務》、《餐飲管理》、《電腦平面設計》、《人力資源開發與管理》、《首飾制作工藝》、《職業規劃與成功素質訓練》、《工商模擬市場實訓》、《綜合布線技術與工程》、《軟件測試》、《室內設計策劃》、《玩具機構設計與制作》、《設計色彩》和《稅法》。
省級精品資源***享課程：玩具制圖與Auto CAD、電腦平面設計。
省級精品視頻公開課程：《包裝設計》、《首飾制作工藝》。
精品課程 序號課程名稱課程負責人所屬教學單位國家級省級市級15門21門40門1玩具制圖與AutoCAD何友義機械與電子系2004年度2003年度第二批2電腦平面設計關俊良藝術設計學院2004年度2004年度第二批3綜合布線技術與工程余明輝軟件學院2005年度2005年度第二批4色彩徐飛藝術設計學院2005年度2005年度第二批5首飾制作工藝袁軍平珠寶學院2007年度2007年度第二批6玩具機構分析與應用渠川鈺機械與電子系2007年度2006年度第壹批7包裝設計陳希藝術設計學院2007年度2005年度第二批8軟件測試賀平軟件學院2007年度2007年度第二批9工商模擬市場實訓闞雅玲工商管理系2008年度2006年度第二批10稅法楊則文財經系2008年度2008年度第二批11餐飲管理饒雪梅旅遊系2008年度2008年度第壹批12保險實務鄧華麗財經系2009年度2009年度 13人力資源開發與管理肖傳亮旅遊管理系2009年度2008年度第二批14室內設計策劃曹幹藝術設計學院2010年度2009年度第二批15職業規劃與成功素質訓練闞雅玲工商管理系2010年度 第二批16電腦效果圖關俊良藝術設計學院 2006年度第壹批17建築施工技術葉雯建築工程系 2007年度第二批18玩具安全標準與檢測吳勁梅機械與電子系 2007年度第二批19調酒與酒吧管理王明景旅遊管理系 2008年度第二批20通用管理吳強工商管理系 2008年度第二批21會計張蓮苓財經系 2009年度第二批22珠寶玉石鑒定申柯婭珠寶學院 2009年度第二批23數控機床竇凱機械與電子系 第壹批24商業銀行會計賈芳琳財經系 第壹批25導遊業務穰艷玲旅遊管理系 第二批26思想道德修養與法律基礎孫永安基礎課部 第二批27CAD/CAM技術應用林新貴機械與電子系 第二批28進出口業務函電劉剛應用外語系 第二批29推銷實務張曉青工商管理系 第三批30計算機組網技術與工程余明輝信息工程學院 第三批31建築工程計量與計價張強建築工程系 第三批32商業銀行綜合櫃臺業務陳瓊財經系 第三批33商務秘書實務肖傳亮旅遊管理系 第三批34國際貿易實務（雙語）嚴美姬應用外語系 第三批35中國旅遊資源賞析與線路設計郭盛暉旅遊管理系 第四批36進出口業務談判宋梅梅應用外語系 第四批37市場營銷張曉青工商管理系 第四批38ERP沙盤模擬實訓郭立國工商管理系 第四批39國際結算張宏博財經系 第四批40教學企業項目（客戶理財）張蓮苓財經系 第四批41網絡安全蔣亞軍信息工程學院 第四批教學成果 效益協調發展的內涵式發展之路，強化質量意識，以教師為主導，以學生為主體，以培養學生創新精神和職業能力為目標，積極探索教學改革，2001年以來，***有57項教學成果獲得國家、省、市教學成果獎，其中，國家級教學成果二等獎7項，廣東省教學成果壹等獎9項、二等獎13項，廣州市教學成果特等獎4項、壹等獎12項 。
國家級教學成果二等獎：《基於職業發展的高職素質教育體系構建與實踐》 、《商科學生“實戰型、體驗式、網絡化”技能與素質並進的課程創新與實踐》、《皮具行業創新型設計人才“三方融通，三品遞進”培養模式的實踐》、《基於能力核心和項目課程的計算機網絡技術專業中高職銜接課程改革與實踐》、《基於實務教育與創新教育並舉的“玩具機構設計與制作”課程改革與實踐》、《系統改革高職金融專業的探索與實踐》 、《基於職業發展的高職素質教育體系構建與實踐》 。
廣東省教學成果壹等獎：《“玩具機構設計與制作”課程改革與實施》、《以課程研發與建設為抓手打造高質量工商管理專業群的創新與實踐》、《以“三步實踐教學”為核心提升高職財經類專業建設水平的探索與創新》 、《基於崗位職業能力的財經類專業人才培養模式改革與創新》、《基於工作過程導向和學生可持續發展的高職酒店管理專業課程體系建構》、《高職環境藝術設計專業“專業-基礎-專業”項目課程體系的創立與實踐》、《以“高素質、強技能”為本位的高職工商管理類專業特色課程建設》 。
廣東省教學成果二等獎：《高職環境藝術設計專業“室內設計策劃”項目課程開發與實踐》、《構建珠寶首飾類專業“六位壹體”校內生產性實訓基地的探索與實踐》、《基於崗位勝任力的高職網絡技術專業課程體系構建與實踐》、《高職院校服務珠三角經濟轉型提升人才培養質量的實踐探索》、《高職經管類專業跨專業項目課程開發探索與實踐》、《基於工作過程導向和學生可持續發展的高職酒店管理專業課程體系建構》、《基於多元利益主體需求的高職教學質量管理機制創新》、《高職旅遊管理專業“六雙三真壹體化”工學結合人才培養模式的探索與實踐》 。
廣州市教學成果特等獎：《軟件測試課程的創新研究與實踐》、《藝術設計網絡教學平臺研究與教學實踐》、《基於網絡經濟下市場營銷課程實踐性教學的整體優化研究》 、《國家示範高職院校服務珠三角經濟轉型提升人才培養質量的校本探索》
廣州市教學成果壹等獎：《基於就業質量提升的職業核心能力課程與教學研究》、《高職旅遊管理專業“六雙三真壹體化”工學結合人才培養模式的探索與實踐》 、《商科學生“實戰型、體驗式、網絡化”技能與素質並進的課程創新與實踐》、《皮具行業創新型設計人才“三方融通，三品遞進”培養模式的實踐》、《基於能力核心和項目課程的計算機網絡技術專業中高職銜接課程改革與實踐》、《基於實務教育與創新教育並舉的“玩具機構設計與制作”課程改革與實踐》、《系統改革高職金融專業的探索與實踐》、《首飾制作工藝》、《系統改革高職金融專業的探索與實踐》、《基於能力核心和項目課程的計算機網絡技術專業中高職銜接課程改革與實踐》、《珠寶結合——天壇祈年殿》、《多角度高效摘果器》。
截止到2015年2月，廣東番禺技術學院教師以學校為第壹署名出版的著作***290部，其中“十壹五”國家規劃教材21部。
學校廣泛開展國際國內間的交流與合作，加強與海內外知名大學、同類職業技術學院及培訓機構的聯系，壹方面邀請國（境）內外友好或合作院校前來訪問指導，積極探索合作辦學新模式，引進優質職教資源；另壹方面多次派出業務骨幹赴國（境）內外考察培訓，主要學習先進職教理念，科學借鑒成功經驗。學校現已與澳大利亞、日本、韓國、新加坡、印度、比利時、德國和中國香港等國家和地區建立了合作關系。其中，新加坡南洋理工學院還在我校建立了南洋理工學院學生研習基地（廣州） 。 學校圍繞培養“壹技之長+綜合素質”的高技能人才的目標，實行以素質為基礎，以能力為核心，以就業為導向，產學研結合的人才培養模式，積極實施“雙證書”制度，大力培養學生的職業技能，畢業生以其適應性強、動手能力強、綜合素質高而受到用人單位普遍歡迎。自2001年廣東省首次公布高校畢業生就業率以來，學校畢業生就業率壹直穩居全省高校前列，2004年、2005年和2008年三年位居全省所有本專科院校第壹位。
2010年“五壹”勞動節前，學校2001屆模具設計與制造專業畢業生黃德智喜獲“全國勞動模範”崇高榮譽，在北京人民大會堂受到黨中央和國務院的隆重表彰。2010年底被省教育廳授予“廣東省普通高校畢業生就業工作先進集體”榮譽稱號。2013年，畢業生就業率達99.39% 。