“金財工程”自2002年起實行已十年有余。從我國各地方的實踐來看，取得了許多成果。全國各省市已基本推廣了部門預算編制度系統；工資集中系統也廣泛應用；國庫集中支付系統的開發和運行工作也已全面開展。但隨著改革的進壹步深化，也面臨了許多困難。?
（壹）地方縣級“金財工程”發展狀況參差不齊?
我國幅員遼闊，財政系統龐大、復雜，各地經濟發展情況差異較大，各地區子系統建設情況參差不齊，而地市縣級的財政業務系統和網絡建設是全面實現金財工程的重要基石。雖然壹些常用的關鍵系統已經推廣至全國，但對於部分經濟、技術水平落後的地市縣級財管管理系統仍然未能全面開展。深入分析其原因，可以歸納為以下幾點：
壹是部分地方政府對於“金財工程”的緊迫性認知不足。我國系統建設時間較短，且幅員遼闊，很難將壹種經驗全面推廣適用。這就需要各地積極探索和積累相關經驗，因地制宜。壹方面，不斷改革的財政管理體制需要我們盡快完成工程建設，另外壹方面也需要各地為系統建設提供經驗。而系統建設初期又需要投入大量人力和物力，使得地方政府較難推進此項工程。
二是資金來源不明。“金財工程”需要大量的財力投入以建設必要的計算機、系統軟件和網絡設備等，但這些資金主要還是來自於地方政府。上級財政部門僅能解決壹小部分。這無疑增加了地方的財政負擔。
三是技術人才的短缺。專業技術人才是工程建設過程中不可或缺的，但部分地方政府的經濟狀況以及當前的用人制度，無法引進高級技術人才。而已有公務人員的技術水平也未能滿足需要，有待進壹步提高。?
（二）缺乏統壹規劃與建設?
由於建設初期，我國相對缺乏經驗，雖然提出了建設的總體目標，但對財政信息系統的建設缺乏統壹的規劃與開發。各個部門或者地方政府為盡快實現辦公自動化，自行建設和開發了系列的應用軟件。其所使用的技術方法、版本多樣，系統之間不能相通，而需要調試對接。這就極大地阻礙了“金財工程”在全國範圍內的推進。?
其次，眾多軟件功能需要較為單壹，經常出現為了實現某壹功能而單獨配備設置和系統的情況，使得信息管理條塊各功能嚴格分割，而切斷其與其他系統之間的關聯。許多系統只需要在內部完善功能模塊，就可實現功能多樣化。?
再次，由於系統多樣、功能分割嚴重，數據集中和信息***享較為困難，也使得各軟件無法綜合利用。從綜合層面來講，各業務相互獨立，可能造成人力物力投入的重復，使得財政管理的整體效率低下，壹定程度上提高了行政成本。