神奇寶貝動畫到目前為止已經播放了四個主要系列，它們分別對應於主要系列遊戲的內容。根據播出順序，分為第壹部分:官渡應時聯盟、橘子洲橘子洲聯盟（原創動畫）、都市圈城市聯盟、官渡豐原豐原聯盟、深澳深澳聯盟和何忠聯合聯盟。
神奇寶貝五音
精靈寶可夢動畫的第壹個系列沒有印刷標題，是為了與後來的系列區分開來，與遊戲的第壹代和第二代相對應。在這篇未刊發的文章中，新手教練小智從達木博士那裏得到了壹只皮卡丘，它不情願、喜怒無常，不喜歡進入神奇寶貝球。小智離開了家鄉振新鎮，在官渡開始了他的旅程。在贏得皮卡丘的信任後，小智開始了他的旅程，認真挑戰世界各地的道觀並加入神奇寶貝聯盟。和小智壹起踏上旅程的是兩位導師——小剛和小霞。
參加完應時會議後，小智受達木博士委托前往奧蘭群島從內木博士取回GS球，小剛暫時留在內木博士。在旅途中，小智參加了橙色聯盟並遇到了神奇寶貝觀察員肖劍。回到鎮心鎮後，達木博士不知道如何打開GS球，所以他離開了肖劍作為助手，並派肖智、小霞和小剛前往市區將GS球交給歸皮鎮的斯蒂爾先生。第三，小智參加了《神奇寶貝聯盟-城市聯盟》的白銀發布會。
雖然小霞最初跟隨小智是因為皮卡丘毀壞了小霞心愛的自行車，但這成了她加入旅行的機會。在接下來的兩部電影中也再現了類似的破壞自行車的情節。
神奇寶貝超級壹代
主要項目:神奇寶貝高級代
精靈寶可夢系列動畫的第二部，對應遊戲的第三代。小霞不得不回到華蘭城當道場教練，以代替他正在旅行的三個姐姐。小剛和小智因為家裏的事情分開了。小智重新出發，本著以新人的心態繼續學習的心態，所以他只帶著皮卡丘獨自前往豐原地區，在那裏他遇到了新的馴獸師小遙和他的兄弟蕭聲，後來小剛重新加入，所以他們四人開始了新的冒險。
《超世代》分為兩個部分:豐原聯盟和戰鬥開發區。與第壹部不同的是，故事變成了兩條主線:壹方面，小智收集徽章是為了加入逢源聯盟，挑戰道場。聯盟會議後，改為挑戰家鄉官渡的發展區；另壹方面，梅的目標是成為頂級協調培訓師，在世界各地挑戰華麗的比賽，以獲得綬帶並參加華麗的大型慶祝活動。為了實現各自的目標，兩人都與神奇寶貝展開了戰鬥。
神奇寶貝鉆石和珍珠
主物品:神奇寶貝鉆石&；珍珠）
精靈寶可夢系列動畫的第三部，對應遊戲的第四代。在開發區篇章結束後，小梅告別了為了挑戰都市圈華麗競爭而獨自壹人的小智，和蕭聲壹起回到了橙色中國路展館。小智在小茂的鼓勵下，帶著偷渡來的皮卡丘和長尾怪手來到深澳地區開始新的挑戰。
在《鉆石與珍珠》系列中，壹起旅行的主角是小智、新人協調員兼培訓師小光和神奇寶貝飼養員小剛。和《超世代》系列壹樣，小智和小剛都穿著新衣服亮相。他們三個壹起旅行，開始了新的旅程。情節比以前設置得更深。與前壹部相比，小智的道場挑戰和小光的華麗大賽有更多的情節，也有更多的相遇和離別，更多的對手和夥伴。該系列是當前區域文章中最長的壹篇（其次是城市-首都聯盟文章）。
神奇寶貝超級願望
主要項目:神奇寶貝最美好的祝願
精靈寶可夢系列動畫的第四部，對應遊戲的第五代。與前兩部電影類似，《超願》也講述了小智和皮卡丘前往壹個新地區（何忠地區）開始新旅程的故事。目前每周四晚上在東京電視臺播出。
在這壹系列中，小智仍然穿著新衣服出現，她的旅伴在鹿子鎮附近相遇，愛麗絲是壹個自稱來自龍的故鄉的神秘女孩，天桐是三爻道觀的教練。與前兩部電影不同的是，愛麗絲聲稱自己是龍神奇寶貝的主人，但她不是壹個協調的訓練者。因此，前兩部電影中場面沈重的華麗競爭不再出現。這與多年前沒有華麗競爭的非印刷系列非常相似，女主角想成為水系神奇寶貝的主人。此外，何忠的喬伊和瓊莎小姐的設計也不同於以往，幫助喬伊小姐和瓊莎小姐的神奇寶貝也不同。幫助喬伊小姐的不再是吉麗丹或幸運蛋，而是差不多娃娃。
在2012年6月，該系列進入了第二季，冒險舞臺轉移到了“東何忠”地區，主角壹行人將在那裏遇到前四代中的各種神奇寶貝，鉆石&珍珠中小光和辛西婭的角色也出現了。
我不知道它什麽時候會結束，但很快。主角是萬念之大師。