廈門有廈門大學、廈門理工學院、集美大學誠毅學院等7所本科院校，還有廈門海洋職業技術學院、廈門華天涉外職業技術學院、廈門東海職業技術學院等9所專科院校，***有16所高等院校，是福建省高等院校數量最多的城市之壹，也是我國經濟特區當中高等院校數量最多的城市之壹。
部分學校介紹：
1、廈門大學
廈門大學是教育部直屬、中央直管副部級建制的綜合性研究型全國重點大學，世界壹流大學建設高校（A類），國家“211工程“和“985工程”重點建設高校，首批學位授權自主審核單位。
2、集美大學
集美大學是福建省重點建設高校，交通運輸部與福建省、自然資源部與福建省、福建省與廈門市***建高校，福建省壹流大學和壹流學科建設高校，國家“卓越工程師教育培養計劃”試點高校，國家“卓越農林人才教育培養計劃”試點高校，應急管理學院建設首批試點學校，福建省首批“海外華文教育基地”。
3、廈門醫學院
廈門醫學院是福建省為數不多的醫學院校，整體辦學實力位居福建省醫藥類院校前列，是壹所專門以醫藥類人才培養為主的大學。該校近些年來發展較為迅速，隨著今後的進壹步發展，待更名大學的基本條件達成以後，將有可能更名為廈門醫科大學。
4、廈門理工學院
學校最早可追溯至1978年廈門市政府開辦的工業、建築、財經等八個大專班。1981年，以工業大專班師資為主體，在八個大專班的基礎上創建鷺江職業大學。
5、廈門華廈學院
廈門華廈學院（Xiamen Huaxia University）是經教育部批準設立的應用型本科院校。學校創建於1993年，時為私立廈門華廈大學。2001年，更名為“廈門華廈職業學院”。2014年教育部批準在廈門華廈職業學院基礎上籌建本科層次廈門華廈學院，2015年4月28日正式批準設立。
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