哈爾濱工程大學比合肥工業大學在整體實力上更勝壹籌。
1、從全國排名來看，哈爾濱工程大學全國排名第62位，僅次於河海大學；合肥工業大學全國排名第82位，僅次於西南財經大學。
2、從學科實力對比，根據第四輪學科評估哈爾濱工程大學壹***22個學科上榜，其中綜合實力最強的專業學科有：A+類學科1個、A-類學科1個、B+類學科5個；合肥工業大學壹***25個學科上榜，其中綜合實力最強的專業學科有：A類學科1個、B+類學科5個、B類學科6個。
3、從錄取分數線來看，2022年哈爾濱工程大學在河南省最低錄取分數為：理科（本壹）599分，文科（本壹）573分；合肥工業大學2022年在河南省最低錄取分數為：理科（本壹）588分，文科（本壹）550分。
哈爾濱工程大學辦學條件
學校有壹級學科博士學位授權點15個，壹級學科碩士學位授權點32個，博士專業學位類別3個，碩士專業學位類別11個，博士後科研流動站12個，博士後科研工作站3個。國家壹級、二級重點學科各1個，國防特色學科10個，黑龍江省壹級重點學科11個。
哈爾濱工程大學設有17個學院（系、部），開設本科專業65個。學校工程學、化學、材料科學、計算機科學、環境或生態學等5個學科進入ESI全球前1%。
學校有教職工2945人，其中專任教師1916人，具有高級專業技術職務的專任教師1254人。教師隊伍中現有院士7人（含雙聘），“全國創新爭先獎”獲得者4人，各類國家級人才110人次，各類省部級人才120人次；“龍江學者”支持計劃入選者24人。