山東財經大學和南京財經大學各有其獨特優勢，山東財經大學和南京財經大學都是以財經為主的大學，但它們的歷史、地理位置、專業設置、教學風格等方面都有所不同。
南京財經大學位於江蘇省南京市，前身是成立於1956年的糧食部南京糧食學校，是壹所較特殊的財經類院校。南京財經大學在食品科學方向的專業實力不俗，其中食品科學與工程專業還是國家級特色專業。
具體哪個學校好取決於關註的方面和個人的需求。