應用數學系將英國的倫敦政治經濟學院數學系作為參照系，結合上海財經大學的特點和上海的金融環境，不斷改進辦學方針，調整專業設置結構，優化本科生和研究生的培養計劃，以達到畢業生“具有寬厚數學基礎，兼備財經特色”，深受社會用人單位看好的應用型人才。
應用數學系教師承接國家自然科學基金項目4項，並有多項研究成果發表在SCI、EI雜誌和國內壹級雜誌及核心刊物上。