2012年5月，吳晨光出任搜狐網新聞中心總監。2013年10月，接替劉春擔任搜狐網總編輯壹職。
搜狐網內部郵件稱：吳晨光負責搜狐新聞媒體管理，總編室、新聞、財經、軍事、文化、讀書、歷史等頻道，同時搜狐還任命周松為產業媒體中心總經理，負責搜狐產業頻道的管理，包括時尚、女人、奢侈品、母嬰、健康、旅遊、教育等頻道。
2014年春，吳晨光執行搜狐公司董事局主席、CEO張朝陽的命令，對搜狐網內容部進行了“媒體融合變革”，將PC、移動兩部門合為壹體，形成了“中央廚房生產、不同餐廳分發”的新構架。
改革之中，有匿名郵件稱：吳“作風敗壞、公器私用、任人唯親”。吳晨光回應：改革觸動了某些人利益，造謠者將受到法律的嚴厲制裁。
2015年1月，由吳晨光主編的內部資料《搜狐新聞采編規範》走紅，受到了行業的高度追捧。 這本采編規範始於吳晨光的工作日誌，集納了吳晨光及搜狐新聞中心全體員工近3年的業務精髓。