西南大學和西南財經大學的辦學歷史不同。
壹、西南大學
西南大學由原教育部直屬西南師範大學與原農業部直屬西南農業大學於2005年合並而成。原兩校毗鄰而建，均溯源於1906年建立的川東師範學堂。
1936年更名為四川省立教育學院。
1950年，四川省立教育學院師範、農學相關系科分別與1940年創辦的國立女子師範學院、1946年創辦的私立相輝文法學院等合並建立西南師範學院、西南農學院。
1985年，兩校分別更名為西南師範大學、西南農業大學。此後，重慶輕工業職工大學、四川畜牧獸醫學院、中國農業科學院柑桔研究所相繼並入。
二、西南財經大學
學校始於1925年在上海創立的光華大學。
1946年更名為成華大學。
1952至1953年，以成華大學為基礎，先後並入西南地區16所院校的財經系科，組建四川財經學院。
1960年分設四川財經學院和四川科學技術學院。
1961年合並更名為成都大學。
1978年恢復為四川財經學院。
1985年更名為西南財經大學。