主要是審計的內容側重點不同。財經法紀審計主要是審查單位在運營過程中，各項經濟業務中有無違法財經法紀的現象，例如貪汙受賄、挪用公款，或者財經法紀的執行上有無差錯等等。而財產審計主要是審計資產的保值增值情況，有無人為流失，損壞，或不當經營造成財產貶值。
財政財務審計的對象主要是被審計單位財政財務的收支活動；財經法紀審計的對象則是嚴重違反財經法紀的行為；而經濟效益審計的對象是被審計單位的業務經營活動和管理活動。
財政財務審計
在審計產生以後的很長壹段時期都居於主導地位，因此可以說是壹種傳統的審計；又因為這種審計主要是依照國家法律和各種財經方針政策、管理規程進行的，故又稱為依法審計。
我國審計機關在開展財政財務審計的過程中，如果發現被審單位和人員存在嚴重違反國家財經法規、侵占國家資財、損害國家利益的行為，往往會立專案進行深入審查，以查清違法違紀事實，作出相應處罰。這種專案審計壹般稱為財經法紀審計，它實質上只是財政財務審計的深化。
以上內容參考：百度百科-財政財務審計