南京市工商業聯合會，成立於1952，是中華全國工商業聯合會的地方組織，是由南京市各工商企業、團體(私營企業、個體工商戶、三胞投資企業和部分鄉鎮企業)及從事工商經濟工作的人士組成的人民團體和私營商會。本會的宗旨是團結工商界，發揮民間商會的優勢，加強與海外工商界朋友和工商聯的聯系與合作，為南京的社會穩定、改革開放和經濟發展服務，為中國特色社會主義建設和祖國統壹大業貢獻力量。本協會的主要職能是代表和維護會員的合法權益，反映會員的意見、要求和建議；為會員提供信息和技術、管理、法律、會計、審計、融資、咨詢、培訓等服務，組織會員在國外舉辦和參加各類展覽和學習考察，幫助會員開拓國內外市場；加強與香港特別行政區、澳門特別行政區、臺灣省地區和世界各國工商協會和工商界人士的聯系和友誼，促進經濟、技術和貿易合作的發展，協助引進資金、技術和人才；為會員提供相關證明，協調關系，調解經濟糾紛；承辦政府及有關部門委托的事項。
南京市工商聯第十二屆執委有118名執委，45名常委，14名副主席。在市工商聯的辦事機構有:經濟處、聯絡處、會員處、宣傳研究室、辦公室。截至2003年底，全市13個區縣全部恢復或建立了工商聯，62個鄉鎮、59個街道建立了商會。成立60個行業商會。全市工商聯現有團體、企業、個人會員10086人(不含原工商聯會員2408人)，其中非公有制會員8437人，企業會員6484人。基本涵蓋了我市各行業重點非公企業和代表，商會的影響力和凝聚力不斷增強。
南京市工商聯緊緊圍繞市委市政府的工作中心，認真履行各項職能，充分發揮橋梁助手作用，努力做好政務、會務、商務工作。市工商聯有56人分別擔任全國、省、市人大代表和CPPCC委員。其中，全國人大代表和政協委員1人，省人大代表2人，省CPPCC委員8人，市人大代表14人，CPPCC委員31人。