1，企業數據準備階段。本年度被檢查企業的許可證、資質證書、組織機構代碼證和各種施工設備的檢驗報告是否齊全。是否根據企業情況建立了體系，形成了受控文件，並進行改進？系統的建立可以自己完成，也可以找咨詢機構協助，咨詢機構會收取相應的費用。體系文件的建立壹般包括三大體系的手冊、二階控制程序文件、三階各種操作規程、規章制度和壹些記錄文件，其中環境和職業健康涉及到很多法律法規中的危害識別，如果不了解建議詢問咨詢機構。
2.認證申請。企業準備好所有材料和場地後，向認證機構提交認證申請。填寫申請表後，認證機構會根據企業的實際情況擬定合同，合同簽訂後，再進行審核。
3.認證階段。審計機構會派出自己的審計人員對企業進行審計，壹般分為兩個階段。第壹階段是文件審核階段，會向企業提出壹些改進建議。當企業糾正修改意見後，可安排第二階段現場審核。現場審核其實就是看企業是否按照自己制定的制度執行，會對不合格的地方提出改進建議；
4.不合格項的改進和證書的簽發。改進完成後，審核員提出的不合格項由審核員進行驗證，費用結清後認證機構出具認證證書。
法律依據:《中華人民共和國認證認可條例》第十六條。
國家根據經濟和社會發展的需要，推進產品、服務和管理體系認證。
第十七條
認證機構應當按照基本認證標準和認證規則從事認證活動。認證的基本標準和規則由國務院認證認可監督管理部門制定；涉及國務院有關部門職責的，國務院認證認可監督管理部門應當會同國務院有關部門制定。
屬於認證新領域，前款規定的部門尚未制定認證規則的，認證機構可以自行制定認證規則，並報國務院認證認可監督管理部門備案。