臨床工作中，藥師在配藥前應審核處方的規範性和完整性(前言、正文、後記)，處方的診斷性和適宜性，用藥的合理性(給藥途徑、劑量、療程、報銷範圍)。
處方調劑崗是藥師直接面對患者最直接的工作。提供正確的處方審核、調劑、復核和給藥並提供用藥指導，是保證藥物治療的最基本保障，是藥師全部工作中最重要的工作，也是聯系和溝通醫生、藥物和患者的最重要環節。值得註意的是，隨著藥師工作的轉型，調劑工作要從“具體操作體驗服務”向“藥學知識技術服務”轉變。
參與臨床藥物治療的藥學監護，要求藥師在藥物治療的全過程中為患者爭取最佳效果，為患者提供全程藥學服務。這也要求藥師積極參與到藥物治療過程中，運用自己的藥物知識和專業特長、最新的藥物信息和藥物檢測手段，結合臨床實際參與患者用藥，參與合理用藥方案的制定。藥物治療的對象是病人。在目前的藥物臨床治療實踐中，仍然依賴於臨床用藥的經驗，重診斷輕治療的偏向仍然嚴重。不合理用藥事件頻發，藥品資源浪費嚴重。藥師應與臨床醫務人員壹道，將醫療、藥學、護理有機結合，以患者為中心，在藥物治療實踐中研究合理用藥的策略和技巧，制定並實施合理的個體化藥物治療方案，選擇和使用好藥物，以最佳的治療效果和最低的治療風險，共同承擔醫療責任。
治療藥物監測在藥代動力學原理的指導下，應用現代先進的分析技術進行治療藥物監測是藥物治療發展的必然趨勢。藥師在TDM的指導下，通過對患者用藥全過程的監測、藥動學參數的分析，與臨床醫生共同制定和調整合理的個體化用藥方案，是參與臨床藥物治療和提供藥學服務的重要途徑。