簽發植物檢疫證書的目的是表明植物、植物產品或其他限制貨物符合規定的植物檢疫輸入要求，並與相關證書樣本的證明聲明壹致。植物檢疫證書的簽發只能為此目的。
證書樣本提供了制定官方植物檢疫證書時應采用的標準措辭和格式。這對於確保文件的有效性是必要的，也就是說，它們易於識別和報告必要的信息。
進口國只需要受限物質的植物檢疫證書。這些限制包括植物、球莖和塊莖，或商品，如種子、用於繁殖的水果和蔬菜、切花和枝條、谷物和生長介質。植物檢疫證書也可以用於壹些經過加工的植物產品(如木材和棉花)，但其性質或加工性質可能會限制害蟲的傳入。從技術上證明需要植物檢疫措施的其他限制(如空集裝箱、車輛和生物)也可能需要植物檢疫證書。
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