產業化方面，依托基礎軟件國家工程研究中心的中科方得有限公司，先後承擔了無錫可信電子政務產業化項目和安全電子郵件項目，將方得方舟安全操作系統應用於電子郵件系統和電子政務功能網站。此外，中科院軟件所的郵件服務器也是基於中科方得的安全服務器操作系統構建的。
在軟件過程管理方面，中心以“為企業高效管理提供支撐工具和服務”為核心，主要負責CMM/CMMI(L2-L5)、GJB5000-2003、ISO9000/9001的軟件工程工具研發和咨詢服務。基於對軟件過程服務核心技術的多年研究，開發了壹個支持整個軟件生產周期的軟件過程服務集成管理系統QONE。該體系由三個層次組成，包括質量管理、產品工程和服務支持三個平臺，10多個系統集成工具。該產品市場占有率壹直處於國內市場前列，用戶數量處於領先地位，可以替代國外產品。為北京等8個國家級軟件產業基地和廣東等8個863孵化器提供了超過12000授權用戶，為上百家軟件企業提供了近4000授權用戶，為企業建設自主基礎軟件平臺系統和應用解決方案起到了很好的推動作用。中國軟件行業協會系統與軟件過程改進分會第壹屆常務理事會第三次會議表決討論通過，中科方得軟件股份有限公司順利通過考核，成為CSPIN理事單位，進壹步凸顯了公司在軟件過程管理方面的優勢和實力。