2004年底，中國鐵建總醫院正式轉移到北京，並入我院。正式命名為北京朝陽醫院京西院區。我們醫院是2008年第29屆北京奧運會的指定醫院。
醫院現在是兩個站點(本部和京西院區)的醫院。醫院總面積102800平方米(本部50800平方米；京西校區5.2萬平方米)，建築面積21.000平方米(本部1.500平方米；京西校區6萬平米)。1910床位(總部1410床位；京西校區500)。固定資產171950萬元。員工近3600人(本部門2800人；京西校區800人)。門急診約250萬人次，住院約5萬人次，手術約18000臺。
承擔了“十五”和“十壹五”規劃、國家863計劃、國家973計劃、國家非典防控應急科技行動計劃、國家禽流感防控專項基金項目、國家自然科學基金項目、衛生部、教育部、人事部、北京市科研基金項目等多項重點科技攻關項目。，平均每年科研經費約2800萬元，平均發表論文約600篇，平均獲得省部級科技進步獎5項。
醫院承辦《國外醫學器官移植》、《中國病案》、《國外醫學移植與血液凈化》、《中華疝與腹部外科雜誌》等期刊。
首都醫科大學呼吸疾病科(國家生命科學技術人才培養基地呼吸疾病科)、首都醫科大學急診醫學科、首都醫科大學重癥醫學科、首都醫科大學核醫學科、首都醫科大學骨科、首都醫科大學血液科設在我院。
醫院承擔五年制和七年制醫學生的臨床教學、碩士生和博士生的培養、博士後流動站工作；是北京市衛生局住院醫師、專科醫師、全科醫師培訓基地和國家生命科技人才培訓基地，承擔住院醫師、專科醫師、全科醫師規範化培訓等多項教學任務。
北京朝陽醫院應該是壹個能夠充分體現科學精神和人文精神的醫學殿堂，應該成為我國醫療衛生事業改革和發展的思想源泉和動力源泉之壹。