故事發生的地點就在這個月牙形的小島上——初音初音，這裏以壹年四季不可思議的櫻花而聞名。
主人公朝倉純壹在島上的風景學院上學。他有睡覺時看到別人夢境的奇特能力，還會用奶奶教的小魔法做零食。這壹次，純壹在夢裏看到了童年的“妹妹”，但她記不起她的名字了...不幸的是，Junichi的夢想很快被她的姐姐音夢的惡作劇打斷了，但面對如此可愛的妹妹，她不能生氣。上學前，純壹堅持要給妹妹量體溫...(測量方法相當特殊)
事實上，純壹和音夢並不是真正的兄妹。當音夢很小的時候，純壹的家人收養了她。對音夢的照顧純粹而細致，給人的感覺是他們就像壹對戀人。
當他們到達學校時，純壹見到了學院的偶像百合ことり和音夢的好朋友美春。但是，因為是開學第壹天，學校來了壹個轉學生。她其實就是我在純情夢中見到的姐姐——方乃さくら.方奈的出現起初讓春香有些驚慌，但卻覺得有點不自在。
俊壹的恐慌是對的。方乃曰:“我來履行與兄之約！”然而，方奈火熱的激情讓純壹想逃...
事情還沒完。晚上，方奈·さくら又從窗戶偷偷溜進了純壹的房間。無奈的純壹只好用魔法變零食來分散方奈的精力。然而，當他不註意的時候，KISS殺死了Junichi...這壹切碰巧被音夢從門裏看到了，音夢氣沖沖地走了出去...
初音初音第二季DC . ss(* * * 26集)
壹種只存在於初音初音島的不可思議的現象，那種永不雕謝的櫻花已經過去快兩年了。我們的主人公朝倉純壹從風間學園的附屬學校轉到了總校。過著壹成不變的學術生活。從此，他的“累”的口頭禪就消失了。我和我的朋友白河小鳥、天藏美春、水月子、杉並區等人過著同樣的生活。只有壹個讓這壹切發生了巨大的變化。
有壹天，在這個初音初音島上，來了壹個年輕的女孩。她的名字叫愛西亞。為了向俊壹的奶奶學習魔法，我來到離北歐不遠的萬裏尋找。但是俊壹的祖母很久以前就去世了，愛西亞失去了唯壹的希望。純壹只從奶奶那裏學了壹點魔法，從他手裏變出和諧的零食，所以他選擇的路竟然是…！？
初音初音II D.C.II(第* * *集13)
53年後，依然是初音初音，有著櫻花的傳說。五十三年後，它仍然是充滿青春氣息的馮建學院。還有這裏即將發生的另壹個愛情故事和櫻花的傳說有什麽聯系？
櫻內義之，風劍書院的校長，也是《芳乃櫻的家》的主人公，每天都過著平凡而充實的校園生活。然而，就在他身邊，有壹群可愛的女孩。像壹家人壹樣存在的姐妹，朝倉尹姬和朝倉雨萌；青梅竹馬的月亮島之戀；雪村杏的同學；校園偶像百合乃香和神秘女孩天藏夏美。
不知不覺，櫻內義之的生活就像春天的初音初音島，“櫻花”漸漸盛開...
初音初音II第二季D.C.II SS(第* * *集13)
D.C .誕生53年後，粉色的櫻花在島上綻放，壹年四季都有數不清的櫻花在空中飛舞。整個島覆蓋在壹片粉紅色的花的海洋中，時間是冬天。地上是厚厚的積雪，空氣中是純白的雪。這是壹個呼出的空氣會變成白霧，讓人不想起床的季節。義像春天盛開的櫻花樹，總覺得有些東西變了。看著緩緩飄落的櫻花，少年想到了即將到來的春天。生活在櫻花不會雕謝的平凡世界的少年，有能力做零食，看到別人的夢。這既不平凡也不非凡。在雪花和櫻花混合飄落的冬日學院裏，當他遇到壹個小魔法師用他最後的魔法求助時，他很開心。