1.企業應將填好的IATF16949認證申請表連同認證要求中的相關材料提交給認證中心。中心收到認證申請材料後，對文件進行初審，符合要求後出具受理通知書(也就是說，如果提交的材料不全，中心就沒有受理資格，更不要說簽訂支付合同了。申請認證的企業和認證咨詢機構的工作人員對此要引起足夠的重視，以免影響進度。申請認證的企業應根據受理通知書在中心簽訂合同。
2.認證中心收到全額認證費用後，通知企業成立現場檢查組，並在現場檢查前壹周正式將檢查組的組成和檢查方案提交企業確認。
3.現場檢查應當按照《環境標誌產品保障措施指南》的要求和相應的環境標誌產品認證技術要求進行。對於需要檢驗的產品，檢查組負責對申請認證的產品進行抽樣、封樣，送指定的檢驗機構進行檢驗。
4、檢查組應根據企業申請材料、現場檢查和產品環境行為檢查報告，編寫環境標誌產品綜合評價報告，並提交技術委員會審查。
5.認證中心收到技術委員會的評審意見後，將評審意見匯總，提交認證中心總經理審批。
6.認證中心向獲證企業頒發環境標誌證書，並組織公告和宣傳。
7.獲證企業如需鑒定，可向認證中心訂購；如有特殊打印要求，應向認證中心申請備案。
8、年度監督和審計每年壹次。
二、年度監督檢查
1.認證中心應根據企業認證證書的頒發時間制定年檢計劃，提前向企業發出年檢通知。企業應按合同要求繳納年度監督管理費，認證中心成立檢查組在企業內部進行現場檢查。
2.現場檢查。
3.檢查組應根據企業資料、檢查報告和產品檢查報告編寫綜合評估報告，並提交認證中心總經理批準。
4.每年進行壹次年度監督檢查。
第三，重新評估和認證
3年內到期的企業應重新填寫IATF16949認證申請表，連同相關材料壹並提交認證中心。其他認證過程與初始認證相同。