“七七事變”後，日軍全面侵華，戰火在上海、南京迅速蔓延。李新柏在八月被任命到壹個關鍵的位置。後吳天之任安徽圖書館館長。1938年初，日軍開始沿江西進攻安慶。國民黨省政府各部門放棄下屬單位，匆忙撤至安徽省西山區。李新柏聞訊後，立即召開全館職工緊急會議，商討應變措施，動員大家共赴國難，盡最大努力保護國家財產。當時全省藏書近65438+萬冊，尤其是1933年壽縣出土的765.438+08件春秋楚器，尤為珍貴。會上，李新柏果斷決定:挖個坑埋在圖書館後面的空地上，向中央博物館求助。李心柏先是派圖書管理員張誌丹負責將三萬多冊善本和線裝書運到桐城羅佳玲，後又派圖書管理員趙小妹將四萬多冊普通書運到六安。這些書裝在200多個大木箱裏，雇傭了400多名農民工。他們分兩批被擡上路，跋山涉水，歷盡艱辛。中央博物館接到電後，迅速撥出專款，派專人在李新柏的協助下，將楚器物安全運回重慶。在省圖書館的書籍和文物轉移後，安慶成了成衛。李新柏匆匆收拾行囊，過河返回貴池老家。
1938年八月，日軍入侵貴池，李新柏攜家人在山村避難。定居壹段時間後，李建立了壹個學校圖書館，免費幫助十幾個村裏的孩子擺脫無知。次年，在朋友的支持下，在深山裏建起三間小屋，開辦南莊學院，招收校外青年，免費進院。避難期間，他雖然沒有經濟來源，生活十分貧困，但憂國憂民之時，他獻身教育的精神依然不減。
1940年春，李新柏受聘在休寧女子中學、民辦安徽中學教高中語文。1941年春，在朋友的催促下，李新柏當上了私立建國中學的校長。
1942年春，國民黨皖南行政公署主任黃紹庚為紀念上海大學校長余友仁，在歙縣創建了右任中學。黃紹庚親自上門勸他開車，李成了右的總裁。1943年，為了投身於教學事業，他毅然辭去了右任中學校長的職務，到雞西的孔琳省立高級農業學校教中文。1944年，安徽大學皖南分校在休寧萬安鎮誕生，他被聘為該校教授。
1945年8月，李新柏在重慶突然收到毛澤東主席的邀請，邀請他去重慶。他很激動，但由於年事已高，路途遙遠，交通堵塞，無法成行，只好回信表達深深的謝意。
1946年7月，皖南分校並入安徽蕪湖學院，李新柏接任教授，兼任建國中學校長。同時在貴池創辦昭明中文學院，招生開課。許世英是學校的董事長，陳炎生是校長，李新柏是副校長。1947年秋，李心柏辭任安源教授、建中校長，主持昭明學堂約壹年。後來因為學校少數人結成團夥，嚴重影響教學。作為創始人，他感到非常難過，憤然辭職。不久，他受聘在南京的私立安徽中學教語文。1949年春，因病辭官，回貴池休養。
4月21，65438，0949，貴池解放之夜，他帶領群眾吃著釜漿，歡迎軍隊進城。第二天，貴池召開歡迎解放軍大會，李新柏代表各界人士發表了熱情洋溢的歡迎辭。1951年，臥病在床，越來越重，治療無效。他於7月去世，享年77歲。