在由教學向教學科研轉變的過程中，信息學院緊緊依托學校在海洋領域的學術優勢，積極整合校內外資源，形成了以專家系統為核心的特色研究體系，以海洋信息監測與處理技術、海洋防災決策輔助技術和海洋數值模擬計算技術為研究方向，以數字海洋和數字漁業為重點，學院擁有現代化的教學和科研設施，專業實驗中心設有軟件綜合教學實驗室、計算機網絡與信息安全教學實驗室、海洋信息與決策支持系統實驗室、嵌入式系統與信息處理實驗室、計算機組成原理教學實驗室。
2012獲得國家自然科學基金面上項目和專項基金。獲科技部863項目壹項，973二級項目壹項。數字海洋研究所利用數字海洋研究所和數字農業研究所的團隊研究平臺，積極拓展與國家海洋局、上海市科委、農委的科研合作，與東海分局、北海分局、上海市海洋局、奉賢海洋局等承擔了多項重大項目。學院承擔了“優良動物養殖技術城市風暴潮災害輔助決策系統關鍵技術研究”、“海量數據質量研究、南美白對蝦養殖集約化數字化集成系統研究及設備創新”等科研項目。2012年，學院獲得專利42項，進入實際試用20余次，獲得軟件著作權7項10。獲得廣東省科學技術獎2項、上海市浦東新區科學技術獎1項，發表論文95篇，其中SCI 14、EI 19、CPCI-S 1；；出版專著、教材、科普著作83部。
為充分滿足師生的課外學習和科研需求，學院積極利用社會資源，在三零衛士通信有限公司、上海群碩軟件有限公司、上海龍達軟件有限公司、明思(上海)軟件科技有限公司、百圖軟件(上海)有限公司等多家IT企業建立校外教學實習基地，學院註重學生第二課堂的建設。為加強理論聯系實際，提高學生專業學習的積極性和主動性，學院對12級新生開展了晚自習，取得了顯著成效。大學畢業生具有良好的政治素質、社會公德、敬業精神、專業技能和人際交往能力，很多畢業生現在都在微軟、富士通、花旗銀行、聯想集團等知名企業高薪工作。大學生多次在全國大學生數學建模競賽、ERP沙盤模擬競賽、上海市大學生計算機應用能力競賽、第八屆“挑戰杯”大學生創業計劃大賽中取得優異成績。同時，學院加強學生心理健康教育、形勢與政策教育，充分發揮網絡思想政治教育優勢資源，持續推進思想政治教育進輕松課堂，加強大學生道德教育和法制教育，讓正確、積極、健康的思想、文化和信息占領網絡陣地，利用網絡資源與學生進行對話、協商、答疑、引導，有效了解和解決學生思想問題。此外，百年校慶期間，我院師生積極表演，開展了“百年情緣，信仰”&；“心連心”師生聯歡晚會、“慶祝海大百年，踐行勤政忠誠”、“慶祝海大百年”、“百年校慶我愛我們的學校”等活動，展現了“特別能吃苦、特別能戰鬥、特別能奉獻”的高昂鬥誌和戰鬥精神。
在即將到來的“十二五”規劃中，上海海洋大學信息學院將繼續秉承優良的辦學傳統，立足上海，服務全國，不斷改革創新，提高辦學質量，努力實現學校的跨越式發展。