造紙業
金光集團是壹家在環保領域有著頗多爭議的企業，被多個環保組織指責為造成印度尼西亞森林非法采伐率世界最高的元兇。但金光集團自身壹直宣稱“使用的所有木材來源都有合法證明”，並於2004年10月28日宣布暫時中止采伐印尼蘇門答臘島的高保護價值森林。世界自然基金會、綠色和平國際環保非政府組織則都宣稱他們掌握有確鑿證據，證明金光集團與非法采伐有直接聯系。
2009年10月，綠色和平委托獨立檢測機構Integrated Paper Services, Inc.（IPS）在兩個月前對金光集團APP（中國）5個紙張產品的樣本進行了纖維分析。檢測結果顯示，清風 (生活用紙)、紅鋼炮 (復印紙) 和旗艦 (復印紙)這3個品牌的樣本中均含有印尼混合熱帶硬木漿成分，該成分來自於采伐印尼熱帶雨林，而不是金光集團APP所聲稱的漿紙人工林。
金光集團APP對蘇門答臘島上原始森林的亂砍濫伐使得泥炭地森林所儲存二氧化碳大量釋放到空氣中，並直接導致包括蘇門答臘虎與紅猩猩在內的多個物種面臨瀕危狀態。
2004年11月16日，綠色和平在北京舉行新聞發布會公布了《金光集團APP雲南圈地毀林事件調查報告》，並在隨後的新聞發布會上公布了他們所掌握的金光集團非法采伐中國雲南地區原始森林的證據。報告宣稱自2002年8月起金光集團在雲南的思茅、文山、臨滄三地以建設“林漿紙壹體化項目基地”的名義非法砍伐原始森林2750萬畝，但綠色和平的報告遭到了金光集團的否認。此後中國浙江飯店業協會以環保理由向所屬的400多家會員單位發出《關於抵制APP紙產品的通知》，號召他們抵制APP的紙張產品，但該協會遭到金光集團侵犯名譽權的起訴。
在綠色和平和社會輿論的壓力下，金光集團APP在2005年5月向國家林業局做出承諾，表示“遵守國家有關法律和政策”。
2011年7月底，印尼蘇門答臘島上壹只蘇門答臘虎不幸落入金光集團APP人工林林場內的動物陷阱（壹種用來捕獲野生動物的簡易鋼絲圈套。落入圈套的動物通常情況下很難逃脫，並在漫長的痛苦中等待死亡。老虎就是不幸地被這樣的圈套困住，受傷的老虎只能緩慢地、在巨大的痛苦中等待死亡），在被困的第7天，當地森林管理員組成救援小組終於到達現場，試圖將老虎救出，但這只年輕的老虎在援救行動進行到壹半時便溘然而逝。尖銳的鋼絲刺破老虎的壹只前爪讓他無法動彈。由於傷勢嚴重，加上未能及時獲救，這只年輕的雄性老虎最終在所有在場目擊者面前痛苦地死去。全世界僅存不到400只野生蘇門答臘虎，工業化采伐以及大面積人工林種植正在快速的侵食老虎自然的棲息地，迫使這瀕臨滅絕的物種到人類活動區域覓食，加劇了人虎沖突。這只老虎悲慘的命運正見證了瀕危物種賴以生存的森林家園被破壞的結果。
植物油
金光集團擁有40.6萬公頃油棕種植園用於生產棕櫚油，並聲稱可以隨時擴張。在進行種植園擴張的同時，大量熱帶雨林被砍伐，使得當地生態環境失衡，當地物種紅猩猩處境危險。
2012年3月——綠色和平國際發布報告《印尼白木的蹤跡》，指出金光集團APP印尼漿廠涉嫌非法伐運受國際瀕危野生動植物公約CITES保護的瀕危樹種印尼白木（拉敏木）。
2012年3月——國家地理、富士施樂（Xerox）、時裝品牌Mondi確認不再采購APP紙品。
2012年4月——達能集團取消與APP的合約，並承諾發展新政策應對毀林。
2012年5月——綠色和平成功遊說麥肯錫和Skagen Funds棄售他們持有的毀林公司金光集團APP在印尼的上市子公司 Indah Kiat紙業的股票。此外，世界上最大的政府財富基金管理機構挪威政府養老基金和國際銀行International Bank BNP Paribas也棄售了Indah Kiat紙業的股票。
2012年5月24日——綠色和平發布調查報告《從熱帶雨林到包裝盒》，指出全球連鎖餐飲行業巨頭肯德基的紙質包裝品含有熱帶雨林成分。綠色和平要求肯德基及其母公司百勝餐飲集團立即停止直接或者間接購買任何導致熱帶雨林破壞的紙制品，停止成為毀林和破壞生物多樣性的幫兇。7月和10月，肯德基印尼和英國分公司分別取消了與APP的合約。
2012年7月——在綠色和平保護海南天然林工作的推動下，海南省政府出臺壹項新政策旨在保護海南所有的天然林。根據這項新政策，曾涉嫌破壞海南天然林的金光集團APP將不能對其在海南中部山區天然林內的漿紙林進行采伐和收獲。
2013年2月5日——在綠色和平的推動下，金光集團APP宣布“森林保護新政策”，將即刻停止其在印尼供應鏈中所有涉及天然林的作業，以開展高保護價值森林和高碳儲量的評估。此政策包括其在中國區的整體業務。APP在中國也將積極承諾保護中國的天然林，確保漿紙林運營操作不涉及轉換任何的天然林。