香港迪士尼樂園度假區由港府與迪士尼合夥組成的香港國際主題公園有限公司負責興建與營運，港府初期將擁有該公司57%的股權，而迪士尼占43%；公司股本總值57億港元，當中港府會註資32.5億港元，迪士尼註資24.5億港元。雙方將來都可以出售該公司的股票，但迪士尼最少需要持有19億港元的股份，政府則不受最低持股要求規限。股份轉換限制於公園啟用五年後開始，轉換上限每年增加5%。為避免過份影響其他持股人的股份值，任何壹年的最高轉換額不得高於10%。
香港迪士尼樂園度假區的興建費用於1999年估計為141億港元。港府向香港國際主題公園公司提供56億港元的貸款，分25年連同利息攤還。該公司另外透過商業借款籌收資金23億港元。
港府的總投資額是22.45億港元，其中包括上述32.5億港元的註資，相等於股權的57%。同時港府將額外獲得40億港元的附屬股權，代替香港迪士尼樂園的地價。由於竹篙灣當時尚未開發，港府須投資136億港元進行主要基建工程，包括建造聯外道路、兩個公眾碼頭、公***運輸轉駁處、港鐵迪士尼線、警崗、消防局、渠務和排汙設施，以及平整壹塊面積有300公頃的土地。
港府沒有向迪士尼提供免費土地或現金補貼，香港迪士尼樂園度假區用地的地契年期為50年，繼有50年的續約權。香港國際主題公園有限公司可以選擇在啟用後的20年之內，以28億港元（1999年地價市值）買入預留的第二期發展用地，換言之迪士尼擁有該土地的優先發展權。