竹島軍港。它位於著名城市廣島的南部和不太著名的沿海城市巖國的東南部。位於瀨戶內海。
橫須賀軍港。橫須賀港，位於日本本州島東京灣人口中心東海岸，北與橫濱市相連，南與橫須賀市東海岸接壤。它是日本的“帝國海軍之都”。它是二戰時期日本四大軍港之壹。
神戶軍港，位於這片大陸的東南部，位於兵庫縣首府神戶。(海軍造船廠-川崎)
吳海軍軍港和吳軍港位於日本廣島縣，靠近瀨戶內海。它們是二戰時期日本四大海軍軍港之壹。(吳海軍工廠，日本最大的海軍工廠)
佐世保海軍軍港，位於九州島西北海岸的佐世保港，屬於長崎縣，四面環山，入口航道以西被五島列島包圍，是天然良港。北與佐世保市接壤，被九州島的西本根半島和品尾島包圍，呈不規則的“Y”字形。它是二戰時期日本四大軍港之壹。
長崎海軍軍港，位於日本九州長崎市，隸屬長崎縣，是日本西南聯合艦隊的母港。(海軍造船廠-三菱重工)
沖繩白沙灘軍港，位於連勝半島東南海岸，現在是駐日美軍的海軍基地。
那霸軍港，位於沖繩西南海岸，面對東海的那霸灣，是日本沖繩乃至琉球群島最大的城市、港口和海軍基地。現在是駐日美軍的海軍基地。
五河海軍軍港位於日本本州中西部日本海沿岸的重要港口城市五河市。它屬於京都府。林若狹灣西五河灣。
函館軍港，位於日本北海道函館，是壹座新建的軍港。