惠安解放後，人民政府接管了學校，學校仍屬僑辦，面向全縣招生。1954年，為加強黨對學校的領導，惠安縣委、縣政府派黨員劉晉元到學校。同年，黃泰南先生從菲律賓回到家鄉，回到自己創辦的惠南中學，次年出任校長。
黃泰南先生主持學校行政工作後，發揚“簡樸、勤奮”的校訓，與大海溝通，廣泛聯系海外僑胞和港澳臺同胞，多方籌措資金，籌建教室、禮堂、發電廠等校舍，購置圖書、儀器等設備設施，改善辦學條件。1958年秋，校舍初具規模，增加了壹所高中。惠南中學成為惠安縣南部唯壹壹所完全中學，教育質量越來越高，名氣越來越大。後來被稱為惠安縣四大老中學之壹。
“文革”期間，學校教育秩序遭到破壞，更名為“惠安縣東源人民中學”。1978後，學校更名為“福建省惠安惠南中學”。
1982，莊先生任校長時，改組校董事會，羅先生任董事長兼名譽校長。洛法先生、歷任主席及全體董事開展了卓有成效的工作，為改善辦學條件做出了積極貢獻。
1997期間，惠南中學舉辦50周年校慶活動，受到縣委、縣政府的高度重視，被納入惠安縣“慶壹節、慶兩慶”統壹活動，成為全縣人民政治生活中的壹件大事。省、市、縣相關領導，以及部分華僑親屬、鄉鎮領導、海內外校友參加了校慶大會，不僅擴大了學校的影響力，也提高了學校的知名度。
從65438到0998，在政府的重視、社會的支持和師生的努力下，學校順利通過了省教委“三級標準中學”的驗收，從而步入了重點中學的行列。
65438年至0999年，羅炳輝同誌任書記、校長時，為了危房改造，改變學校原有區域布局不合理，率先重新規劃校園，進入新壹輪創業。在僑眷、校友、鄉賢的全力支持下，拆除了危房，修建了教學樓、師生食堂、園丁樓、學生公寓、行政辦公、實驗綜合樓等校舍，並開設了400米田徑運動場。到2004年秋，分階段進行的五年校園改造基本完成，學校面貌煥然壹新，辦學條件更是上了壹層樓。
2004年秋，王宏慶同誌任書記、校長時，經過多方努力和協調，學校的《關於撥專款在輝南中學與上侖村之間鋪路的提案》被列入我縣十壹屆CPPCC二次會議第54號提案，受到縣委、縣政府的高度重視。該項目於2005年至2007年被列入該縣自然村公路通達項目庫，計劃於2006年建成通車。
2005年4月，第六屆校董事會隆重成立，董事長為校友、企業家黃俊誌先生。成立大會當天，鄉賢和校友們表現出極大的熱情，踴躍捐款建言，為學校獎學金活動的開展提供了堅強的後盾。校董會已經成為辦學的重要支撐力量。
在社會各界的支持和全體師生的共同努力下，學校於2005年5月25日高分通過省級“二級標準中學”驗收，並於2006年2月13日由省教育廳正式確認並授牌。2012年中，學校以高分通過省級“壹流標準中學”驗收，輝南中學於2012年2月30日正式通過省級“壹流標準中學”。學校的規範推進為今後的進壹步發展奠定了新的更高的起點，各項工作也逐漸進入發展的快車道。
建校60年來，教師生活提高，* *培養了2萬多名初高中學生，其中有許多卓有成就的教授、研究人員、黨政軍各級領導、實業家，還有壹大批活躍在各行各業的勞動模範和骨幹人才...可謂“桃李滿天下，人才遍地”。