1、資產類，
反映醫院全部資產狀況的總賬科目，按資金的流動性強弱，分為“現金”、“銀行存款”、“其他貨幣資金”、“應收票據”、“應收在院病人醫療款”、“應收醫療款”、“其他應收款”、“壞賬準備”、“庫存物資”、“在加工材料”、“待攤費用”、“長期投資”、“固定資產”、“累計折舊”、“固定資產清理”、“在建工程”、“無形資產”、“累計攤銷”、“長期待攤費用”、“待處理財產損益”等科目。
2、負債類，
反映醫院全部負債狀況的總賬科目，按不同的債權人和債務類型，分為“短期借款”、“應交款項”、“應付票據”、“應付賬款”、“預收醫療款”、“應付職工薪酬”、“應付福利費”、“應付社會保障費”、“應交稅費”、“其他應付款”、“預提費用”、“長期借款”、“長期應付款”、“應交藥品收入”等科目。
3、基金類，
反映醫院全部基金狀況的總賬科目，按基金的用途，分為“事業基金”、“專項基金”、“待沖基金”、“待沖財政基金”、“待沖科教項目基金”、“財政補助結轉（余）”、“科教項目結轉（余）”、“本期結余”、“結余分配”等科目。
4、收支類，
反映醫院全部收入和費用支出狀況的總賬科目，按收入的來源和支出和去向，分為“醫療收入”、“醫療業務成本”、“其他收入”、“其他支出”、“財政補助收入”、“財政補助支出”、“科教項目收入”、“科教項目支出”、“管理費用”、“投資收益”等科目。