1、化肥和農藥不合理的使用
據統計，我國每年化肥的使用量已經超過4100萬噸，成為世界第壹大化肥消費大國[2]。為了提高農產品的增收量，含磷、氮等化學肥料被大量運用，長期使用這些化學肥料，會破壞土壤結構，擾亂土壤內部營養成分的平衡，造成土壤結塊，土質變差，儲水功能降低等壹系列問題。農產品的數量是大大提高了，但其質量卻令人擔憂。因為過量使用化肥會使壹些農作物在生長過程中吸收過多硝酸鹽，動物或人體食進這些含硝酸鹽的農作物後，將影響體內氧氣的運輸，使其患病，嚴重時甚至死亡。
同樣，大量農藥的使用對土壤也造成了很大危害。大部分的農藥是有機農藥，其含有很多有害化學物質，如苯氧基鏈烷酸酯類農藥、多環芳烴、二惡英、鄰苯二甲酸酯等等。這些有害化學物質將近1/2會殘留在土壤中，隨著時間的推移，在生物、非生物以及陽光等***同作用下，有害化學物就成了土壤中的組成成分，種植在土壤上的農作物又從土壤中吸收有害物質，在植物根、莖、葉、果實和種子中積累，通過食物，人體和動物食用後就會引發各種疾病。
2、重金屬元素導致的土壤汙染
農用化學物質的過度使用，工業汙染的加劇，使得重金屬汙染日益嚴重。土壤中的重金屬元素來源主要有三方面：隨固體廢棄物進入土壤的重金屬，隨著汙水灌溉進入土壤的重金屬和隨著大氣沈降進入土壤的重金屬。固體廢棄物種類繁多，結構復雜，其中由工業和礦業產生的固體廢棄物汙染最為嚴重。而固體廢棄物中含有大量的重金屬，通過日曬雨淋等作用，重金屬就會被土壤吸收並擴散。生活汙水，石油化工汙水，工礦企業汙水和城市混合汙水是汙水的四大來源，汙水中含有大量的鉛、鉻、汞、銅等重金屬，汙水的任意排放或處理不合理，都將導致汙水中的重金屬元素轉移到土壤中，從而影響土質惡化。所有的這些重金屬汙染物進入到土壤中後，因其移動性差，停滯的時間長，大部分的微生物難以對其分解，且其可以經過水、植物等介質最終危害到人類。
3、牲畜排泄物和生物殘體對土壤的汙染
牲畜和人的糞便，以及屠宰產的廢物常常沒經過有效處理就直接排放到土壤中，其中的寄生蟲和病毒就會引起土壤和水的汙染，有時還會使土壤中毒，變化土壤原本的正常狀態，有害土壤通過水和農作物最終又會危害到人類。
4、汙水灌溉對土壤的汙染
我國是壹個農業大國，需要大量的水來對農作物進行灌溉。然而，水脈都是相連的，生活汙水和工業廢水壹旦沒經過科學的處理就排放，使得大量的汙水流到農田，被汙水灌溉過的農作物就會帶有多種有害的物質，致使食用後的人類和動物生病。
5、大氣汙染對土壤的汙染
大氣中的硫氧化物、氮氧化物和顆粒物等有害物質，經過各種化學物理反應，形成酸雨，酸雨進入到土壤中，使土壤酸化。冶金工業排放的金屬氧化物粉塵，則在重力作用下以降塵形式進入土壤，形成以排汙工廠為中心、半徑為2～3km範圍的點狀汙染[3]。這將使土壤成分發生變化，影響土質性質，不利於植物的生長。
6、土壤侵蝕
土壤侵蝕主要包括荒漠化、沙塵暴與沙漠化。地球潰瘍癥是對土地荒漠化的形象描述，自然環境中的水蝕、鹽漬化、石漠化等，使得地球的潰瘍癥越發嚴重。例如我國的黃土高坡，其土壤成分主要是粉沙，粉沙的粘著力差，又易被水溶解，壹旦遇到惡劣暴雨天氣，就會被水沖走，既不適合植被的生長，生物的生存，還會造成河床淤積，降低河流湖泊的蓄洪排澇能力。近幾年裏，我國多個城市沙塵暴出現率猛增，這與濫墾草原，過度砍伐樹木而引起的土壤風蝕密切相關。被風蝕侵害的土壤水土流失嚴重，植被生長困難，使得大部分土地不能被利用。