1、先查閱資料確定妳的研究主題和內容。
2、對妳確定好的研究點進行查新（也就是請有科技情報查新資格的單位幫妳檢索查閱妳的研究點是否新穎，壹般是查不到或很少查到已經有研究結果則可認為新）。
3、到國家自然基金委網站（或其它單位）下載國家自然科學基金項目申請書，並按照裏面要求的條款和資料逐項填寫好，也就是常說的填寫標書。這部分的工作至關重要。
4、將寫好的標書和要求的相關材料上交妳項目的依托單位的主管部門審核（在高校的話這部門通常是科研處或科研部）。
5、審核通過後，填寫承諾書、簽字蓋章等。
6、最好將所有相關申請材料上交給依托單位的主管部門，紙質版和電子版的都要。同時將電子版上傳到國家自然基金委指定網站和項目申報系統。
7、國家自然科學基金委組織專家審閱和審批。
8、國家自然科學基金委公布結果。
二、20世紀80年代初，為推動我國科技體制改革，變革科研經費撥款方式，中國科學院89位院士（學部委員）致函黨中央、國務院，建議設立面向全國的自然科學基金，得到黨中央、國務院的首肯。隨後，在鄧小平同誌的親切關懷下，國務院於1986年2月14日批準成立國家自然科學基金委員會。自然科學基金堅持支持基礎研究，逐漸形成和發展了由研究項目、人才項目和環境條件項目三大系列組成的資助格局。二十多年來，自然科學基金在推動我國自然科學基礎研究的發展，促進基礎學科建設，發現、培養優秀科技人才等方面取得了巨大成績。