壹、社會保障基金基金收入的審計
1.根據國務院頒布的《社會保險費征繳暫行條例》和其它有關征收社保基金的法規.監督檢查社會保障基金繳款單位和個人是否按國家法規和部門規定的項目和此例及時、足額繳納社會保障基金.，有無不按時繳納、截留、挪用或非法侵占社會保障基金的問題。檢查基金管理機構對征收對象的基礎資料統計是否準確， 如對養老保險基金審計，檢查有無應參加統籌的企業事業單位和職工而未參加者，企業、事業單位的人數、工資總額等基礎資料是否真實，有無通過漏報工資總額、職工人數而少繳基金等問題。有無拒繳基金的問題。未經財政機關和基金管理部門批準， 不按時繳納社會保障基金的，除按規定補繳外， 是否還按規定交納了滯納金。對於截圍、挪用或采用非法手段侵占社會保障基金的， 除追回基金外. 由主管部門對直接責任人 和有關人員給予相應的行政處分，並對單位處於壹定的罰款.構成犯罪的， 由司法機關追究有關人員的法律責任。對財政劃轉的基金， 應檢查是否及時足額地劃轉到基金管理機構。
2 基金的投資收益和基金的利息收人是否及時收回或記帳，有無將投資收益和利息收入等存入帳外，私設“小金庫”甚至貪汙私分等違法違紀問題。
二、對社會保障基金支出的審計
1.監督檢查社會保障基金的專款專用情況。主要是監督檢查社會保障基金是否嚴格按國家有關規定，專門用於社會保障事業.有無違反規定擅自改變基金的用途將被稱為“養命錢”和“保命錢”的基金用於其他方面的開支。在我國，目前由於社會保障制度還不健全，社會保障事業不夠發達，手段落後，有些基金的使用或發放是通過參保單位執行的.因此審計時應深入到參保單位調查，基金有無被挪用於流動資金或其他不正當的開支，有無拖貸發放情況。
2.監督檢查社會保障基金的開支範圍。主要是監督檢查社會保障基金是否嚴格按照國家規定的開支範圍，正確組織支付.有無擴大開支範圍，把不屬於基金負擔的支出列入基金支出 ，而屬於基金負擔的支出卻沒有開支。如醫療保險基金和生育保險基金的支付，有無虛報冒頓、報銷自費藥品和營養藥品等現象； 職工工傷保險基金支付. 對工傷保險基金開支範圍的認定是否符合法規制度，有無不符合工傷基金開支範圍的傷病享受了工傷保險基金；醫療保險基金和生育保險基金中， 有無濫開藥品和超範圍檢查等問題
3.監督檢查社會保障基金的開支標準。主要是監督檢查各項杜會保障基金的開支是否按法定的標準執行. 有無違反國家規定擅自提高或降低開支標準的問腰。如工傷保險基金支付中.職工因工傷殘的等級鑒定即工傷保險基金的開支標準鑒定， 是否符合{擊規糊度，是否符合實際情況；養老保險基金的支付中. 是否在同壹地區執行不同的標準， 執行行業自定的標準等問題。
4.監督檢查社會保險基金的支出結構。主要是監督檢查各項社會保障基金的支出結構是否合理， 給受保護的支出與管理機構提取的管理費之間的比例是否正常，有無亂提管理費從而擠占基金、損害受保護利益的問題。各項社會保障基金給付受保人的支出中， 其內部分項支出比倒是否合理正常，有無本末倒置、暗輕畸重的現象。如對失業保險基金審計中，要檢查失業人員的救濟金、轉業訓練費、生產自救費等分配和支出比例是否合法、合規，有無違反規定擅自壓低失業人員救濟標準， 片面擴大專業訓練費和生產自救費支出的現象； 有無違反規定擅自提取管理費、人員揮霍浪費腐敗等現象。
三、對社會保障基金管理的審計
1 檢查社會保障基金的各項管理制度是否健全有效，地方出臺的管理制度和國家、部門法規是否壹致，基金管理機構的內部控制制度是否完善，能否保證基金合法、合規運作。
2 監督檢查社會保障基金收入專戶儲存情況。社臺保障基金收人是否堅持收支兩條線原則按時上繳財政專戶儲存.有無多頭開戶、儲蓄存款、公款私存等問題。
3 監督檢查社會保障基金個人帳戶情況.有些基盒按規定應建立個人帳戶管理，主要檢查進出項目是否按規定建立個人帳戶，個人帳戶的設置是否齊全，收支情況是否清楚，有無違反財經紀律挪用個人帳戶基金的情況。
4.監督檢查杜會保障基金的保值增值情況。主要檢查基金運作過程是否符臺保值增值的需要，有無保值增值的具體措施.增值的幅度是否正常，基金有無貶值的現象。
5 是否建立有效監督機構和管理內控制度。
四、對社會保障基金結余的審計
1.社會保障基金結余的安全性。主要檢查社會保障基金的結余帳面數字是否準確，以及結余基金的具體分布情況，應納入專戶儲存的是否納入專戶，有無將結余的基金用於國家明令禁止的投資項目，有無藏匿、轉移、挪用、貪汙結余基金等問題。
2.主要監督檢查社會保障基金結余的規模和結構是否合理，基金的結余營運，投資是否符合國家規定，投資的方向，結構，規摸是否合理.是否符合安全性、流動性、效益性的原則.做到基金的安全保值和增值。