負責與沽源縣醫保局定點醫療機構、定點藥店簽訂醫療保險服務合同，並對執行情況進行監督、檢查和考核，對定點醫療機構、定點藥店的違法醫療行為進行處罰；
沽源縣醫療保險局負責指導基本醫療保險業務。
沽源縣醫療保險管理局是市人力資源和社會保障局領導下的全額撥款事業單位。
沽源縣醫療保險局下屬事業單位
1，資金結算部分
負責沽源縣醫保局財務、統計和業務指導及基金培訓工作。
沽源縣醫保局負責核銷醫療保險個人賬戶金額，並為參保人員辦理個人賬戶轉移和個人賬戶儲存繼承手續。
負責沽源縣醫保局日常事務，統籌受理離休幹部醫藥費，即費用的收集、核實、審核，統籌支付離休幹部醫藥費，建立離休幹部檔案，提供相應的配套服務。
按照財務管理體制，負責沽源縣醫保局行政財務、醫療保險、工傷保險、生育保險基金和離休幹部醫療費的財務管理。
2.辦公室
負責沽源縣醫保局擬定本單位年度工作計劃和總結，起草會議材料和文件報告，負責沽源縣醫保局匯總發布沽源縣醫改信息，規範本單位各類綜合文字材料。
負責固原縣醫保局精神文明建設、單位形象工程建設、行政效能監察、創建"三優"文明窗口、創建青年文明號等活動。
負責沽源縣醫保局報紙訂閱和辦公用品的管理。
負責醫保局、沽源縣領導交辦的統戰、普法、計生、綜治等其他工作。
3.醫療管理科
負責沽源縣醫保局醫保費用的審核，沽源縣醫保局參保患者轉診情況的審核，沽源縣醫保局規定病種的審批。
負責沽源縣醫保局特定病種患者證、卡的審批工作。
負責沽源縣醫保局工傷、生育保險待遇統計分析，提出工傷浮動費率的數字依據。
沽源縣醫保局負責對定點醫療機構和定點零售藥店的條件和資格進行調查和審查。