馬軍8歲就讀於私立學校，17歲就讀於省會第壹中學，接受了初步的愛國主義教育。學習期間參加了《愛國壹片》等話劇演出，參加了反對日貨的鬥爭。1915，考入天津市南開中學，參加周恩來等組織的“奉獻音樂社”，擔任學校講座、學生研討會、自治會會長，亦舒服務團總導演、教務長。
馬軍的宣傳和組織能力非常出色。1919五四運動期間，廣泛組織學生，發起並建立學生會，成為五四運動的主要青年領袖之壹。後被選為“天津學生聯合會”副會長、“天津各界聯合會”負責人，領導天津各界舉行罷課、罷課、示威等鬥爭。同年6月，他與郭隆真、劉清揚等65，438+00人赴京，敦促北洋軍閥拒絕簽訂《巴黎和約》。經過頑強而激烈的鬥爭，反帝愛國運動取得了勝利。8月，魯司令馬良殘酷鎮壓群眾，摧毀了濟南“穆斯林救國救民會”等愛國團體，殺害了馬、朱春香、朱春濤等該會會長及愛國回族領導人。並逮捕了大批學生，制造了震驚全國的“濟南慘案”。馬軍和劉清揚在天津發表演講，揭露馬良殺害回族愛國同胞的罪行。8月26日，天津市各界聯合會推舉馬軍到北京請願，由京津請願學生推舉為總指揮。他帶領4000人在天安門廣場請願，要求懲罰馬良，釋放第壹次請願的代表。結果，他被捕了。後來，由於全國人民的抗議和壓力，北洋政府不得不釋放所有被捕的代表。
為廣泛開展愛國學生運動，1919年9月，馬軍與、、鄧等20名青年男女成立革命小組，代號為29號，後改名為年九，並出版了《覺悟》雜誌。他還發表文章鼓勵革命青年。65438年6月+10月，赴上海參加組織成立“全國各界聯合會”，被選為總指揮，領導了著名的“反帝大遊行”。1920年回到天津參加反對日貨鬥爭，再次被捕入獄。在監獄裏，他仍然堅持戰鬥，讀馬克思主義書籍，發表演講，演愛國劇。7月，經過多方救助，馬軍被釋放。
1921年7月，馬俊在天津入黨，成為天津市第壹批黨員。1922年赴哈爾濱從事地下工作，組織“救國覺醒團”，進行反帝愛國宣傳。他在寧安建立了吉林省第壹個黨小組，是東北黨組織的創始人之壹。1925年五卅運動期間，他帶領吉林人民給予支援，組織了以各界人士為會長的“吉林上海案件支援會”。舉行大規模的反帝愛國運動。同年6月，被派往蘇聯莫斯科中山大學學習。次年9月，當選為中山大學學生公社書記。
1927大革命失敗後，馬俊被調回中國，任中共中央書記處書記、組織部長，北京各級黨組織得到重建和恢復。在極其危險和困難的條件下與敵人合作。
1927 12、馬俊因為漢奸的背叛，被法西斯逮捕，在獄中受盡折磨。敵人許諾高官厚祿。他說:“我不宣傳馬列主義，不搞革命，比太陽從西邊出來還難！”在獄中，他不屈不撓，受盡折磨。1928二月15壯烈犧牲，年僅33歲。
新中國成立後，黨和政府為馬俊舉行了公祭儀式1951年10月，在日壇公園為他豎起了墓碑。馬俊的家鄉寧安縣有“馬俊烈士紀念室”，記載著他的英雄事跡。