數學研究所現設有基礎數學實驗室、非線性分析實驗室、幾何分析青少年研究中心、動力系統研究中心、計算機科學實驗室、晨興數學中心。此外，還建立了壹個核心數學挑戰性問題的國際研究小組。國際研究團隊主要成員包括國家傑出青年基金獲得者、中科院百人計劃獲得者、海外著名學者計劃獲得者。他們瞄準核心數學的國際前沿問題，潛心研究，努力攻關。
長期以來，數學所形成了豐富、寬松、自由的學術研究氛圍。數學有很多各種各樣的定期研討會。周五的綜合普及報告會是數學所科研學術活動的重要組成部分。壹般每隔壹周舉行壹次，壹般在周五下午，前半小時是喝茶時間，讓大家有機會互相交流學術。
數學研究所是中國最早的數學研究機構之壹。數學所與國外學術交流頻繁，是其科學研究和學術活動的重要組成部分。許多國際知名的數學家訪問過數學研究所，並成為該研究所的名譽教授。數學研究所與許多世界壹流的數學研究機構保持密切聯系。數學所的科研人員也有相當的自由出國(境)進行學術交流活動。
陳星數學中心以著名數學家丘成桐教授為學術主任，楊樂院士為常務副主任，常年組織學術活動，舉辦專題學術研討會，邀請國際知名數學家講學。晨興中心的學術活動吸引了國內外優秀的青年數學家和博士後來所參觀學習。晨興數學中心作為數學所與研究所學術交流的窗口，發揮著極其重要的作用。
數學研究所於1999建立了華數學講座。華數學講座每年6月165438+10月舉辦，邀請兩位在數學領域有突出成就的數學家進行演講。、陸啟鏗、吳文俊、、楊樂、萬哲賢、顧朝浩、教授在華講堂發表了演講。2003年華數學講座將邀請丁院士、蔣伯駒院士主講。
數學所是國家最早批準授予碩士、博士學位的單位之壹，也是國家首批批準的博士後科研流動站之壹。基礎數學、計算數學和計算機軟件與理論碩士。許多研究生和博士後在國內外的大學、研究機構和其他部門擔任重要職務。目前有碩士研究生30人，博士研究生52人，博士後18人。
自2004年起，基礎數學專業只招收碩士和博士研究生，不再招收碩士研究生。碩士、博士研究生學制為五年。碩士生-博士生入學後前兩年學習學位課程，第三年開始從事專題研究，準備博士論文。參照國際壹流大學和研究機構的標準，制定較為完善的研究生學位課程體系。同時調動我院強大的師資力量，落實各類學位課程的教學任務。我們將為研究生提供寬松的學習環境、優厚的生活條件和自由選擇學位課程和論文導師的機會，努力使學生接受嚴格、規範、系統、全面的高水平數學訓練。
數學研究所是中國數學學會的附屬單位，主辦《數學雜誌》(中英文版)和《數學翻譯》。其中，《數學學報》中文版為國家核心數學期刊，英文版現由斯普林格出版社出版，是SCI收錄期刊之壹。數學譯林主要介紹國際上重要的數學進展、學科和專題、人物傳記和有趣的數學史料等。這是壹本受歡迎的讀物，擁有廣泛的讀者群。