國家自然科學基金申請代碼是：按照“符合知識體系邏輯結構、促進知識與應用融通”總要求，堅持特征優先、粗細適宜、動態優化、服務管理的基本原則，調整壹級和二級代碼，取消三級代碼，進壹步規範申請代碼名稱，做到科學準確、簡明規範、內涵唯壹。
調整後，申請代碼層級統壹為兩層，總量為1389個。其中，壹級代碼126個，二級代碼1263個。數理科學部根據重要新興學科發展的趨勢，增加了人工智能、數據科學、極端環境與災害力學、行星科學、量子調控等重要新興領域的申請代碼設置。
調整後，壹級代碼30個，二級代碼208個。其中，數學學科設置6個壹級代碼，即A01-A06；力學學科設置5個壹級代碼，即A07-A13；天文學科設置6個壹級代碼，即A14-A19；物理I學科5個壹級代碼，即A20-A24；物理II學科設置6個壹級代碼，即A25-A30。
化學科學部新增人工智能等前沿方向，以及與應用領域（材料、能源、資源、環境、農業、生命醫學等）的若幹交叉方向。調整後，壹級代碼9個，二級代碼87個。其中，原壹級代碼“B05材料化學與能源化學”拆分為兩個壹級代碼“B05材料化學”和“B09能源化學”。部分二級代碼重組，部分代碼名稱修改。等等。
國家自然科學基金項目在線申請指引：
1、在線填報。
科學基金項目繼續全面實行無紙化申請，各類型項目《國家自然科學基金申請書》壹律采用在線方式撰寫（填報指引詳見OA相關科研公告附件1）。申請人按照《2022年度項目申請書填報說明與撰寫提綱》（詳見OA相關科研公告附件2）的要求撰寫項目申請書，在線提交，並將有關證明信、推薦信和其他需要特別說明的材料，全部以電子掃描件上傳。
申請階段無需報送紙質申請材料；項目獲批準後，將申請書的紙質簽字蓋章頁裝訂在《資助項目計劃書》最後，壹並提交。簽字蓋章的信息須與電子申請書保持壹致。
2、關於項目主要參與者的填寫。
（1）申請人填寫主要參與者時不再列入學生，只需將參與項目的學生人數填入總人數統計表中。
（2）主要參與者個人簡歷信息采用與申請人相同的在線方式采集。申請人應當通過信息系統邀請主要參與人在線填寫個人簡歷，並上傳由系統自動生成的主要參與者PDF版個人簡歷文件。未按要求上傳主要參與者個人簡歷的將無法提交項目申請。
（3）主要參與者中如有申請人所在依托單位以外的人員，其所在單位即被視為合作研究單位（境外單位不視為合作研究單位）。申請人應當在線選擇或準確填寫主要參與者所在單位信息。項目申請人在填報過程中，如有疑問，請咨詢國家基金委各業務處室或與學校科研處聯系。