人民幣基金分為外資人民幣基金和內資人民幣基金。外資人民幣基金部分由境外投資者出資，但在境內投資時，如其字面含義所指，使用人民幣、內資人民幣基金和美元基金的來源。
(2)人民幣基金和美元基金基於不同的法律基礎。
人民幣基金的設立適用中國法律；美元基金的設立應受美國或開曼群島、英屬維爾京群島和其他司法管轄區的法律管轄。
(3)人民幣基金和美元基金的投資限制不同。
美元基金投資中國企業受《外商投資產業指導目錄》限制，部分領域無法控制或投資；外資人民幣基金的投資方向仍受《外商投資企業法》的限制，而內資人民幣基金的投資方向與其他內資公司相同，限制較少，更具靈活性。
(4)人民幣基金和美元基金的退出路徑不同。
美元基金通常在投資時設立離岸控股結構，退出時將被投資企業在境外交易所上市或轉讓境外控股公司股權；人民幣基金通常尋求在中國上市，或者在中國轉讓股權或資產。
(5)人民幣基金和美元基金享受不同的稅收優惠。
人民幣基金最大的問題是不能像美元基金壹樣享受完全的稅收優惠，部分人民幣基金由於法律不銜接，仍然面臨雙重征稅的困擾。
(6)人民幣基金被法律認可才幾年，投資的項目大部分還在成熟期，退出的情況不多。相對於“雙頭”美元基金，更加本土化的人民幣基金能否像壹些審批制下的美元基金壹樣取得輝煌的成功(雖然很多操盤手都來自這些美元基金)，還需要時間的檢驗。但在“中概股”聲譽受損、中國收緊海外上市政策的情況下，美元基金能否復制此前的成功，也值得觀察。