市物價局設8個內設機構（正處級)。
（壹）辦公室
負責機關日常政務、會務、文秘、外事、接待、政務公開和信息工作；負責信訪、檔案和督察督辦工作；負責機關辦公自動化、財務、資產管理工作；負責保密、保衛及後勤保障工作。
（二）綜合法規處（反價格壟斷處）
負責編制價格工作中長期規劃；負責提出價格總水平年度調控目標和對策建議；負責提出價格改革和價格調整的年度計劃，參與研究制定重大價格改革方案；負責價格綜合性文件的起草工作；負責組織開展價格理論與政策研究；負責組織價格地方性法規、規章和規範性文件擬訂工作；負責擬訂和調整地方定價管理目錄；負責組織價格聽證會；負責價格行政復議與行政訴訟工作；負責物價宣傳和普法工作；負責指導區縣（自治縣）物價工作；負責價格調節基金的設立審查；負責涉嫌價格壟斷行為的調查和認定。
（三）商品價格管理處
負責管理重要的儲備物資價格、部分農產品和農業生產資料價格、部分國家專營的商品價格、重要交通運輸價格、供水價格；負責管理壟斷性水、電、氣安裝服務收費標準和重要能源產品價格。
（四）醫藥價格管理處
負責管理全市藥品價格；負責擬訂和調整政府定價藥品目錄；負責擬訂全市醫療服務價格項目及收費標準；負責管理疾病預防控制收費標準；負責醫療器械和醫用耗材價格的監管工作；負責組織實施藥品價格信息發布工作。
（五）房地產價格管理處
負責管理城鄉建設、規劃、市政、國土房管及礦產系統行政事業性和經營服務性收費標準及其中介組織服務收費標準；負責組織擬訂城鎮國有土地基準地價、標定地價、限價商品住房、經濟適用房、公有和廉租住房價格或租金；參與擬訂建築安裝工程定額標準，實施有關建安材料的價格指導。
（六）收費管理處
負責管理行政事業性收費、部分經營服務性收費、中介服務收費標準和旅遊、涉外價格；會同相關部門審核行政事業性收費項目和收費標準；負責核發收費許可證，組織實施收費年審和收費統計工作；負責價格評估機構資質認定和價格評估人員執業資格認定工作。
（七）市場價格監測處
負責市場價格監測網絡的建設；組織實施國家價格監測報告制度；加強對重要商品價格和服務價格的監測、預測和預警；組織開展三峽工程庫區移民補償投資價格的調查。
（八）幹部人事處（離退休人員工作處）
負責機關和所屬單位的人事、機構編制、隊伍建設以及離退休人員管理等工作。
機關黨委負責機關和所屬單位的黨群工作。
市紀委、市監察局派駐市物價局紀檢組監察室監督檢查市物價局貫徹執行黨的路線、方針、政策和決議，遵守國家法律、法規和執行市委、市政府的決議、決定、命令的情況;監督檢查市物價局黨組和行政領導班子及其成員維護黨的政治紀律、貫徹執行民主集中制、選拔任用領導幹部、貫徹落實黨風廉政建設責任制和廉政勤政的情況;經批準，初步核實市物價局黨組和行政領導班子及其成員違反黨紀政紀的問題；參與調查市物價局黨組和行政領導班子及其成員違反黨紀政紀的案件；按照有關規定，調查市物價局處級及其以下幹部違反黨紀政紀的案件及其他重要案件;協助市物價局黨組和行政領導班子抓好市物價局黨風廉政建設和反腐敗工作;受理對市物價局黨組織、黨員和行政監察對象的檢舉、控告，在職權範圍內受理市物價局黨員和行政監察對象不服處分的申訴;承辦市紀委市監察局交辦的其他事項。重慶市物價局價格監督檢查分局（重慶市價格舉報中心）為重慶市物價局管理的處級行政機構。主要負責組織、指導、協調全市價格監督檢查工作；依法查處或配合查處價格欺詐、低價傾銷、牟取暴利等不正當價格行為和價格壟斷行為；組織實施商品明碼標價和收費公示制度；受理價格舉報投訴，協調解決價格矛盾糾紛。
重慶市物價局價格成本調查隊（重慶市價格信息中心）為重慶市物價局管理的處級行政機構。主要負責重要農產品成本調查；負責全市主要商品、服務收費的價格成本調查工作；按規定實施價格成本監審；指導區縣（自治縣）價格成本監審和成本調查工作；指導企業成本管理工作。
下屬機構
重慶市物價局價格檢查分局（重慶市價格舉報中心）
重慶市價格信息中心
重慶市價格認證中心