截至2014年5月，學校已成立閩南文化研究所、鄧小平理論研究所、教育科學研究所、文化詩學研究所、語言文化研究所、德育研究所、儒學與傳統文化研究所、信息技術研究所、圖書情報研究所、離散數學研究所、生物技術研究所、季羨林研究所、巴哈伊研究所、歷史研究所、應用心理學研究所、計算機應用技術研究所、應用化學研究所、 現代測試技術研究所、環境科學與工程研究所、人力資源研究所、市場營銷研究所、老年學研究所、區域經濟研究所、文學藝術傳播研究所、膜科學與工程研究所、編輯學與文化產業研究所、毛澤東思想和中國特色社會主義理論體系研究所、漳州經濟發展研究所、人口、家庭與社會發展研究中心、精細化工研究所、先進陶瓷材料研究所、 彰泰休閑食品茶飲料研究所、花卉研究所、知識產權研究中心、臺商研究中心、法治漳州研究中心、谷文昌精神研究中心等研究機構。
省級重點實驗室:粒計算及其應用重點實驗室、現代分離分析科學與技術重點實驗室、認知與人格重點實驗室。
省部級人文社會科學基地:海峽兩岸閩南文化研究交流基地、閩臺區域文化與文學研究中心。
福建社會科學研究基地:閩南文化研究中心
省級2011協同創新項目:海峽兩岸文化發展協同創新中心、區域鄉村教師發展協同創新中心。
科研創新平臺:現代分離分析科學與技術重點實驗室、顆粒計算重點實驗室、真菌產業工程技術中心、文化詩學研究所、應用心理研究所、閩南文化研究所。2006年至2015年6月，全校共獲批設立各級科研項目約700項，其中國家自然科學基金資助項目36項。國家社科基金項目30項(其中國家社科基金後期資助項目1，國家社科基金專項委托項目1)，教育部人文社科項目20項，全國高校古籍整理工作委員會項目2項，省級科研項目138，省部級以上科研成果獎20項。其中，高菲教授參與的項目“碳團簇形成的研究”獲得了2006年國家自然科學獎二等獎。朱峰教授獲得國際IEEE粒子計算學會2012年度傑出貢獻獎。截止2012年底，我校教師發表科研論文4205篇，其中SCI、EI、ISTP收錄論文375篇。從2012開始，閩南師範大學在“十二五”期間主持了福建省教育綜合改革的5個重點項目。從2004年到2011，學校贊助出版教材和著作36部，參編圖書80余部，翻譯圖書10冊，申請專利12項。入選中國文化創意產業網“2013中國文化創意產業學術研究十大領先高校”。2014年5月獲得國家語委批準的四個重點項目1。
2013年，學校獲得國家社科基金項目5項，其中面上項目3項，後期資助項目1項，專項委托項目1項，* * *獲得資助1.02萬元；* * *批準國家自然科學基金項目6項，其中面上項目3項，青年科學基金項目3項，總批準金額285萬元。獲得福建省社科規劃項目22項，其中面上項目15，青年項目7項，資助29.5萬元，在福建省高校中排名第五。獲得福建省中青年教師教育科研項目17，438+03，其中傑青2項，產學研1，壹般13；社科A類項目21，其中新世紀項目1，重點項目3個，漢語言文字委員會專項1，壹般項目16。獲得省教育廳2013年度A類第二批人文社會科學研究項目(海峽兩岸職業教育項目)3項。獲得2013、1重點項目、1壹般項目兩個省級思想政治工作研究項目。獲得福建省委宣傳部2013立項4項，福建省中國特色社會主義理論體系研究中心下達的年度課題2項，壹般課題2項。
學校* * *有6個項目入選市自然科學基金委2013年度科技項目計劃，批準率86%，項目批準數為漳州各單位之最；17項目入選漳州市人文社科項目，其中面上項目6個，青年項目2個，自提項目9個。2013年初至9月，全校申請發明專利8項，其中實用新型專利14項，授權11項。此外，9月份學校教師與企業簽訂合同8份，總金額125.26萬元，收到資金37.49萬元，其中當年27.89萬元，歷年9.6萬元。到2015年8月，圖書館擁有紙質圖書220萬冊，電子圖書286.37萬冊，中外文紙質期刊5000余種。訂購了中國期刊網、方正Apabi教學參考書、超星數字圖書館、SD、Springer外文電子書刊等中外文數據庫40余種。其中，2065438+2003年采購圖書文獻經費803.2萬元，新購圖書110000冊，電子圖書257860冊。
自建數據庫方面，共有八個數據庫，包括閩南地方文化特色數據庫、語言學科數據庫閩方言、語言學科數據庫英語學習策略、福建教師數據庫、閩臺生態農業數據庫、館際互借全文數據庫、教學參考書數據庫和隨書光盤系統。