自1986年成立來，中心主要工作如下：1. 學術研討會，2. 出學術研討會論文集, 3. 海外青年學者歸國訪問計劃, 4. 協聯成員及其論文。
1. 學術研討會
中心成立十幾年來，每年都組織二十幾次專題學術研討會，由國內外在各科技領域前沿工作的科學家主持，其中交叉學科的學術會議尤其得到關註。1986－2004年總計舉行了338次學術研討會， 參加總人數為18, 466人。其中國際學術研討會18次，參加人數為1,610人；國內學術研討會320次，參加人數為16, 856人， 中心的活動促進了國內有關科學領域水平的提高，增加了國內外科學技術的交流，特別是青年科學家之間的學術交流。環境科學方面的學術會議，尤其受到國內學術界和有關部門的重視。
2. 學術研討會論文集
中心主持的學術會議，有些是研討最新的科研專題，有些是研討有長期影響的科研專題，大部分的報告材料都是文獻中沒有或難以找到的。為此，應科學界的需要，中心印發每次學術會議的文集，無償提供全國科學工作者、研究生使用。1986-2004年，總計印發論文集 175集。
3. 青年歸國訪問學者
1990年，在當時西方國家對中國實行制裁的情況下，中心在中國科學院和國家計委、國家自然科學基金委的支持下，實施了“海外青年學者歸國訪問計劃”，保持了國外最前沿科學與國內的交流，並大大增加了在國外的中國學者，尤其是青年學者對祖國的了解與聯系，推動了在國外的青年學者回國從事研究工作，效果很好，受到廣泛的贊揚。1990－2004年青年歸國學者總人數為192人次。
4. 協聯成員及其論文
按照中心制行的評價標準，在科研工作中做出成績的理論物理學者，均可申請成為中心的協聯成員。在世界重要的科學學術刊物上發表的論文，必須達到國際水平，都需經過極嚴格的同行評審。因此，中心鼓勵其協聯成員在全世界最重要的學術刊物上發表研究成果，以提高國內研究工作的水平。1986-2004年協聯成員在世界最高水平科學雜誌上發表理論物理論文總數為3991篇。