國家自然科學基金項目《動態數據挖掘中的演化聚類模型與算法研究》（71171030），項目負責人.
國家自然科學基金項目《時間序列數據挖掘中的聚類模型與算法研究》（70871015），項目負責人.
國家自然科學基金項目《獨立成分分析的有效算法及應用研究》（10571018），項目負責人.
新世紀優秀人才支持計劃《基於優化理論和多元統計分析的數據挖掘與知識發現方法及應用研究》（NCET-11-0050），項目負責人.
中國博士後科學基金《支持向量機優化模型與算法研究》（No.2003033153）》，項目負責人.
大連理工大學青年教師培養基金資助項目《數據挖掘與機器學習中的優化方法研究》，項目負責人.
大連理工大學985學科建設項目《大規模演化優化模型方法及應用研究》，項目負責人.
大連理工大學985學科建設項目《生物系統的建模、仿真及可視化研究》》，項目負責人.
中央高校基本科研業務費專項項目（No．DUT11SX04）：時間序列特征表示與相似性度量方法，項目負責人.
大連理工大學“軟件+X” 交叉學科建設專項項目（重點項目）《可信軟件的組合測試即時算法及工具》，第二項目負責人.
國家自然科學基金重點項目《面向產品生命周期的知識協調管理若幹理論與方法研究》（71031002），主要參加人員。
國家高科技研究發展計劃863項目《企業知識管理方法及企業本體論》，（2008AA04Z107），主要參加人員。
國家自然科學基金重點項目《企業(組織)知識管理若幹基礎問題研究》（70431001），主要參加人員。
國家自然科學基金重大國際合作研究項目《知識集成與知識創新的基礎理論研究》，主要參加人員。
國家自然科學基金項目《面向大規模流數據的完備性挖掘方法研究》（No.60403021），主要參加人員。
國家973重點基礎研究發展項目《信息技術的應用理論與高性能軟件》（No. G1998030414）的子課題《萬維網上的數據集成、數據倉儲及知識發現的有效算法與軟件系統》，主要參加人員。
國家自然科學基金重大項目《支持宏觀經濟決策的人機結合綜合集成體系研究》（No.79990580）的子課題《與宏觀經濟決策有關的認知與知識發現技術（KDD）研究》，主要參加人員。
北京市科委重大項目子課題《中醫個體化診療數據倉庫與數據挖掘的研究》，主要參加人員。
國家自然科學基金重大研究計劃項目子課題《生物信息學中信息理論方法的研究與應用》，（No.90103033），主要參加人員。
國家自然科學基金項目《多目標動態投入產出優化模型與算法研究》（No.10071010），主要參加人員。
大連市計委項目《大連市“十五”時期經濟社會發展分析和預測研究》，主要參加人員。
河南省科委項目《21世紀初河南省經濟、科技、社會可持續發展戰略研究》，主要參加人員。
河南省交通廳項目《河南省“十五”時期及2015年公路交通基礎產業發展研究》，主要參加人員。