1992年6月，原化學工業部黨組研究制訂了化工行業深化改革和適應社會主義市場經濟體制的戰略部署，決定以化工部直屬的中國化工建設總公司、中國化工供銷總公司、中國化學工程總公司、中國化工裝備總公司、中國化工新材料總公司等“五大公司”和南京化工廠為主體組建中國昊華化工（集團）總公司，在化學工業全面實施“大公司、大集團”戰略。1992年12月31日得到國務院生產辦公室正式批準，1993年2月領取營業執照，於1994年9月正式掛牌運行。
1996年至1998年，原化工部機構改革時成立的18家公司劃歸昊華公司，經過調整、撤並和改組，充實了昊華的隊伍。1996至1998年，國家確認昊華公司作為化工行業中央級“撥改貸”轉國家資本金的出資人地位，涉及化工企業164家，***31.29億元人民幣。1998年初，昊華公司與國家石油和化學工業局“脫鉤”，重組後以集團公司建制進入中央管理序列，由中央企業工作委員會直接管理。
1999年，原化工部所屬18家科研院所按中央政策轉制後進入昊華公司，昊華公司成為境內最大且化工科研實力最強的大型化工企業，為實現科研生產壹體化，提升昊華的核心競爭力奠定了基礎。
2001年，原化工部地質礦山局及所屬單位重組改制為中國明達化工礦山總公司劃歸昊華公司。宣化化工總廠、河北辛集化工集團等企業相繼進入昊華公司。同年，國家計委、財政部聯合發文，將18.59億元特種“撥改貸”和經營基金劃入昊華並轉為國家資本金，至此昊華公司初步打下了科研、工業生產、貿易和金融業務相結合的大型化工企業集團的基礎，擁有具有外事權、外貿權、特殊化學品專營權和非銀行金融業務經營權。
2001年7月，昊華公司研究制定出“十五”發展規劃，明確公司定位為“以科技為先導，新型材料為主業，金融貿易為兩翼，科、工、貿、金壹體化的大型科技產業集團”，並確定了“十五”經濟指標。2003年，湖南益陽橡膠機械集團公司、桂林橡膠機械廠相繼劃歸昊華公司，橡膠機械生產能力躍居國內前列。2004年，昊華公司收購河北中意玻璃鋼公司；山西原平化工集團公司進入昊華公司；托管四平聯化；以增資方式相對控股河南宇航化工公司。昊華公司通過實施資本運作、產品結構調整和科技創新三個殺手鐧，獲得了超常規發展，大大提升了公司的競爭力。
2004年5月，由昊華公司與藍星公司***同發起組建的中國化工集團公司正式掛牌運行，搭建了壹個更為寬廣的發展平臺。原昊華公司所屬中國化工信息中心、中國明達化工礦業總公司、中國華辰化工技術經濟中心、中國化工新材料總公司、中國化工裝備總公司等五個單位移交中國化工集團公司直接管理。
2005年，昊華公司對自貢鴻鶴化工公司實現了無償劃轉，並以增資擴股方式對河南駿馬化工集團實現相對控股。
2006年3月，昊華南方橡膠公司與桂林市國資委簽訂《產權轉讓協議》，受讓桂林輪胎廠、桂林乳膠廠、桂林南方橡膠公司橡膠制品廠三家企業全部股權。2006年6月，昊華北方公司與天津大學簽訂《重組天津天大天久科技股份有限公司意向書》。2006年11月，昊華公司與河南輪胎集團有限公司簽訂《風神輪胎股份有限公司國有股轉讓協議書》，河南輪胎集團有限責任公司將持有的1億股風神輪胎股份有限公司股權無償劃轉給昊華公司。
2008年3月，昊華公司進行戰略重組，原昊華公司所屬的昊華南方（桂林）橡膠有限責任公司、中聯橡膠（集團）總公司、天華化工機械及自動化研究設計院等15家單位移交中國化工集團公司其它專業公司管理。新疆中泰化學股份有限公司、黑龍江黑化集團股份有限公司、湖南省湘維有限公司等九家企業進入昊華管理序列。