簡單來說，兩者的主要區別在於前者投資二級市場，後者投資壹級市場。如果再細分，可以從以下幾個方面進行區分:
1，投資方向。私募股權投資基金主要投資於二級市場，即股票、債券、期貨等上市交易品種。私募基金投資的是非上市公司的股權，通常是那些成長性好的中小公司(多為新三板)。
2.投資周期。私募股權投資基金發行產品後募集的資金直接投資於二級市場，但二級市場退出渠道多，容易成交，單筆投資周期很短。私募基金投資非上市公司，如果要增值轉讓，壹般需要上市。上市流程非常復雜，壹般在2-3年，加上前期調研，單個投資周期通常需要5年甚至7年。
3.收入。私募股權投資基金投資於二級市場，收益來源基本可以分為資本利得、分紅等。，而且收入也不是特別高。而私募基金通常投資的公司壹旦上市，有可能賺幾倍幾倍。當然，高收益伴隨著高風險。萬壹所投資的未上市企業破產，股權基金將血本無歸。
4.附加服務。私募股權投資基金通常只買賣上市公司的股票，而私募股權基金在投資企業的同時，會給被投資企業帶來先進的管理經驗、再融資、拓展銷售渠道等額外的增值服務。因為這樣有利於被投資企業的成長，增加被投資企業的價值，上市時可以“賣個更好的價錢”，私募基金的回報也會更多。
像現在市場上的陽光私募，本質上是私募投資基金，只是由信托公司發行，私募投資基金由私募基金管理人發行。
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