1984年在Utah州的Alta,White R and Mendelsonhn M受美國能源部(DOE）的委托主持召開了壹個小型專業會議討論測定人類整個基因組的DNA序列的意義和前景（Cook Deegan RM,1989）
1985年5月在加州Santa Cruz由美國DOE的Sinsheimer RL主持的會議上提出了測定人類基因組全序列的動議，形成了美國能源部的“人類基因組計劃”草案。
1986年3月，在新墨西哥州的Santa Fe討論了這壹計劃的可行性，隨後DOE宣布實施這壹計劃。
1986年遺傳學家McKusick V提出從整個基因組的層次研究遺傳的科學稱為“基因組學”
1987年初，美國能源部和國立衛生研究院為HGP下撥了啟動經費約550萬美元（全年1.66億美元）
1988年，美國成立了“國家人類基因組研究中心”由Watson J出任第壹任主任
1990年10月1日，經美國國會批準美國HGP正式啟動，總體計劃在15年內投入至少30億美元進行人類全基因組的分析。
1987年，意大利***和國國家研究委員會開始HGP研究，其特點是技術多樣（YAC，雜種細胞，cDNA等）、區域集中（基本上限於Xq24-qter區域）
1989年2月英國開始HGP，特點是：帝國癌癥研究基金會與國家醫學研究委員會(ICRP-MRC)***同負責全國協調與資金調控，劍橋附近的Sanger中心註重首先在線蟲基因組上積累經驗，改進大規模DNA測序技術；同時建立了YAC庫的篩選與克隆、特異細胞系、DNA探針、基因組DNA、cDNA文庫、比較生物基因組DNA序列、信息分析等的“英國人類基因組資源中心”。可謂“資源集中、全國協調”。
1990年6月法蘭西***和國的HGP啟動。科學研究部委托國家醫學科學院制定HGP，主要特點是註重整體基因組、cDNA和自動化。建立了人類多態性研究中心（CEPH），在全基因組YAC重疊群、微衛星標記（遺傳圖）的構建以及馳名世界的用作基因組研究的經典材料CEPH家系（80個3代多個體家系）方面產生了巨大影響。
1995年德意誌聯邦***和國開始HGP，來勢迅猛，先後成立了資源中心和基因掃描定位中心，並開始對21號染色體的大規模測序工作。
1990年6月歐***體通過了“歐洲人類基因組研究計劃”，主要資助23個實驗室重點用於“資源中心”的建立和運轉。還有丹麥王國、俄羅斯聯邦、日本、大韓民國、澳大利亞等。
1994年，我國HGP在吳旻、強伯勤、陳竺、楊煥明的倡導下啟動，最初由國家自然科學基金會和863高科技計劃的支持下，先後啟動了“中華民族基因組中若幹位點基因結構的研究”和“重大疾病相關基因的定位、克隆、結構和功能研究”，1998年在國家科技部的領導和牽線下，1998年在上海成立了南方基因中心，1999年在北京成立了北方人類基因組中心，1998年，組建了中科院遺傳所。1999年7月在國際人類基因組註冊，得到完成人類3號染色體短臂上壹個約30Mb區域的測序任務，該區域約占人類整個基因組的1％。