協會擁有健全的決策、監察、執行機構，並於2012年先後創建全國首家環保組織的黨支部和工會，2013年建立團支部、婦委會。現任會長、法人代表為第七屆“地球獎”、第六屆中國青年豐田環保獎獲得者，浙江大學管理學院黨委副書記阮俊華；現任中國杭州低碳科技館館長吉京杭、杭州市中策職業學校高級教師戚誌堅和中國青年五四獎章獲得者忻皓擔任副會長，其中忻皓兼秘書長、黨支部書記。
浙江省綠色科技文化促進會第壹次會員代表大會選舉產生協會第壹屆理事會，此後壹屆壹次理事會選舉產生常務理事。分別為：
王誌強 浙江電視臺教育科技頻道總監助理、主持人
方雨 浙江之聲主持人
許諾 浙江電臺交通之聲主持人
許婷 浙江衛視首席主播
範惠閔 浙江電視臺錢江都市頻道首席主播
鄭培欽 浙江歌舞劇院首席歌唱家
席文 浙江衛視首席主播
姜楠 浙江電視臺錢江都市頻道新聞部副主任、首席主播
戒清 杭州凈慈寺方丈、浙江省青年聯合會副主席
崔巍 杭州歌劇舞劇院院長、浙江省舞蹈家協會主席
萬裏紅 上海世博會特聘禮儀顧問
沈浩 中國美院書法系主任
青春大使
飛揚 浙江之聲主播
杭州市生態文化大使
楊蒞 杭州電視臺生活頻道副總監
臧錦宜 杭州電視臺西湖頻珠頻道首席主播 徐本亮 上海市慈善培訓中心副主任
胡勇耀 浙江省青年成才基金會秘書長、浙江省希望工程辦公室負責人、浙江正泰公益基金會秘書長
李力 北京市朝陽區環友科學技術研究中心理事長 陳臻（女） 陽光時代律師事務所創始人、主任
浙江省綠色科技文化促進會理事會
常務理事（***5名）：
吉京杭 中國杭州低碳科技館館長
阮俊華 浙江大學管理學院黨委副書記
吳根軍 嘉興市人民政府駐京辦主任
忻皓 杭州市生態文化協會黨支部書記、副會長
戚誌堅（女） 杭州市中策職業學校高級教師
理事（***20名）：
王米娜（女） 浙江衛視新聞中心采編部副主任
王倩（女） 杭州師範大學團委常委、誌願者指導中心主任
王敏娜（女） 杭州超騰環境工程有限公司董事長
方明和 溫州市綠眼睛環境文化中心理事長
葉麗榕（女） 雙槍竹木科技有限責任公司董事
吉京杭 中國杭州低碳科技館館長
劉明峰 杭州愛立特生態環境科技有限公司董事長
阮永斌 浙江美宏健康管理有限公司董事長
阮俊華 浙江大學管理學院黨委副書記
孫耀琴（女） 原浙江省國土資源執法監察局局長
吳根軍 嘉興市人民政府駐京辦主任
張誌劍 浙江大學中國西部發展研究院水生態與流域建設研究中心主任
張杭君 杭州師範大學生命與環境科學學院副院長
忻皓 杭州市生態文化協會副會長、秘書長
鄭壹零 華夏公益發展中心、第九世界公益俱樂部負責人
俞真（女） 杭州市慈善總會杭州網義工分會秘書長
屠佳（女） 浙江工業大學團委副書記
戚誌堅（女） 杭州市中策職業學校高級教師
潘能兵 浙江迅華科技有限公司董事長
魏鈞 浙江省慈善總會義工部主任、滴水公益品牌創建人
杭州市生態文化協會理監事會
常務理事（***9名）:
阮俊華 浙江大學管理學院黨委副書記
戚誌堅 杭州市中策職業學校高級教師
江靜 中國杭州低碳科技館副館長
孫耀琴 浙江省農民專業合作社聯合會副秘書長
苗青 浙江省人才研究院秘書長、浙江大學公***管理學院副教授
潘蔡葉 寧波正清環保科技有限公司總經理
忻皓 浙江省綠色科技文化促進會副會長、秘書長
葉麗榕 雙槍竹木科技股份有限公司董事
蔡誌豪 浙江電視臺錢江都市頻道新聞部副主任
理事（***41名）：
教育科技界（12名）
周偉華 浙江大學管理學院副院長
戚誌堅 杭州市中策職業學校高級教師
沈威 杭州師範大學團委書記
竺照軒 中國美術學院團委書記
呂媛媛 浙江理工大學團委副書記
李俊 浙江科技學院團委副書記
曹楨 浙江財經大學城鄉規劃管理學院黨總支副書記
徐超 浙江工業大學環境科學研究中心副教授
洪秀平 平和語言文化培訓學校
江靜 中國杭州低碳科技館副館長
項光宏 聚光科技（杭州）股份有限公司環境事業部研究中心副總監
張雍 浙江省環境保護科學設計研究院
公***管理界（6名）
苗 青 浙江省人才研究院秘書長、浙江大學公***管理學院副教授
孫耀琴 原浙江省國土資源執法監察局局長
劉國翰 浙江理工大學法政學院公***管理系講師
葉軍 杭州市保障性住房建設管理辦公室建設管理處處長
林慶來 浙江省環境執法稽查總隊監察稽查室主任
畢欣欣 中國國際民間組織合作促進會氣候變化網絡協調員協調人
經濟管理界（8名）
阮俊華 浙江大學管理學院黨委副書記
潘蔡葉 寧波正清環保科技有限公司總經理
項謝銀 浙江人立環保有限公司董事長
張曉寧 杭州普惠通信設備有限公司董事長
吳冰心 杭州朗盾科技有限公司董事長
孟鏑 杭州格臨檢測有限公司總經理
張藝群 杭州金藝旅行社有限公司總經理
李震 杭州申奇廢品回收連鎖有限公司副總經理
新聞出版界（7名）
蔡誌豪 浙江電視臺錢江都市頻道新聞部副主任
戴家琪 浙江電臺交通之聲新聞部主任
王磊 錢江晚報杭州新聞部副主任
李天瓊 杭州電視臺綜合頻道主持人、杭州錢塘論壇工作室主任
許雲峰 都市快報記者
王淑媛 浙江電視臺少兒頻道記者
金蘭 杭州電視臺西湖明珠頻道首席記者、責任編輯
社會人士界（8名）
忻皓 浙江省綠色科技文化促進會副會長、秘書長
葉麗榕 雙槍竹木科技股份有限公司董事
王承超 求是強鷹俱樂部秘書長
高水娟 開心廚娘餐館總經理
張海芳 杭州錢江航運公司退休職工
邵鋒 浙江方圓檢測集團股份有限公司業務市場部報告管理
張琦 浙江省綠色科技文化促進會國際義工部
何潭振 中華兒女報刊社浙江記者站副站長
監事（***5名）：
張翼翀 浙江省青少年校外教育中心網絡事業部部長
馬雷 杭州綠色文化傳播有限公司總經理
錢申喬 蒙牛乳業（集團）股份有限公司公***事務總監
曹亮 杭州市環保誌願服務總隊副總隊長
裘竹如 浙江日報文化藝術部副主任 中國民間環保組織真正強大起來，不僅需要提高組織的項目技能，更需提高自身管理水平。兩年來，協會以財務批露、社團評估、黨群工會建設、ISO9001質量管理體系建立為核心，全面建立內控管理機制，正向影響社會對民間力量看法，積極爭取政府、企業購買社會組織服務，有效推動協會的社會地位提高，並於2012年底成為中國草根民間環保組織中首家5A級社團。
2012年初，協會加入壹基金USDO自律吧，以最高級別四級財務信息披露為要求聘請專職會計，參加非營利組織財務3A培訓班，奠定NGO財務規範基礎。7月在中國公益慈善項目展示交流會上成為首批進行財務信息披露的中國三家NGO之壹。2012年底，協會因財務信息披露的積極表現，獲壹基金“典範工程獎”。2012年，協會以社會組織等級評估為契機，對照標準逐項完善工作、健全制度。協會還參與NPI組織的NGO能力建設導師計劃，聘請上海慈善教育培訓中心副主任徐本亮為公益導師，完成理事會治理在內的組織治理輔導，團隊凝聚力、執行力大為提高。2012年6月和9月，協會先後建立中國草根民間環保組織首家黨支部和工會，2013年2月建立團支部。黨群工會的建立，豐富了協會與外界聯系渠道，協會通過這些渠道向民政部、團中央和省、市相關部門提出合理化建議數條，推動保障社會組織從業人員的各種利益，有效提高民間組織的社會地位。2013年初，協會在中國賽寶認證中心的指導下，開展建立ISO9001質量管理體系。標準化協會服務和管理，將為中國民間環保組織積累重要的經驗。 耀善堂是協會為紀念協會兩位已故的“終身貢獻獎”的會員汪耀祥、詹良善而在辦公室專門設置的員工會員學習交流區域，位於杭州市下城區紹興路337號野風現代之星大廈2204室。“耀善堂”的名字是從汪耀祥和詹良善兩位逝者的名字中各取壹字，“耀善”之意即為“光耀揚善”。居中正沙發上方的“耀善堂”三字則由中華詩詞學會發起人、浙江省辭賦學會第壹副會長吳亞卿所提寫。在耀善堂中，除了壹些書籍和光盤外，還可以看到兩位逝者生前的筆跡、圖片甚至錄音、錄像，尤其珍貴的是汪耀祥為錢塘第壹護江碑最終定稿親筆書寫的碑文原稿和他生前最後壹封信的原件，詹良善十多年前初識綠色浙江的明信片也可以從這裏找到。