（1） 投資者地位不同。股票持有人是公司的股東，有權對公司的重大決策發表自己的意見；債券的持有人是債券發行人的債權入，享有到期收回本息的權利：基金單位的持有人是基金的受益人。體現的是信托關系。
（2） 風險程度不同。壹般情況下，股票的風險大於基金。對中小投資者而言，由於受可支配資產總量的限制，只能直接投資於少數幾只股票、這就犯了“把所有雞蛋放在壹個籃子裏”的投資禁忌，當其所投資的股票因股市下跌或企業財務狀況惡化時，資本金有可能化為烏有：而基金的基本原則是組合投資，分散風險，把資金按不同的比例分別投於個同期限、不同種類的有價證券，把風險降至最低程度。債券在壹般情況下，本金得到保證，收益相對固乙風險比基金要小。
（3） 收益情況不同。基金和股票的收益是不確定的，而債券的收益是確定的。壹般情況下，基金收益比債券高。以美國投資基金為例，國際投資者基金等25種基金1976～1981年5年間的收益增長乍，平均為301.6％，其中最高的20世紀增長投資者基金為465％，最低的晉利特倫德基金為243％；而1996年國內發行的之種5年期政府債券，利率分別只有13．06％和8.8％。
（4） 投資方式不同。與股票、債券的投資者不同，證券投資基金是壹種間接的證券投資方式，基金的投資者不再直接參與有價證券的買賣活動，不再直接承擔投資風險，而是由專家具體負責投資方向的確定、投資對象的選擇。
（5） 價格取向不同。在宏觀政治、經濟環境壹致的情況下，基金的價格主要決定於資產凈值；而影響債券價格的主要因素是利率；股票的價格則受供求關系的影響巨大。
（6） 投資回收方式不同。債券投資是有壹定期限的，期滿後收回本金；股票投資是無限期的，除非公司破產、進入清算，投資者不得從公司收回投資，如要收回，只能在證券交易市場上按市場價格變現；投資基金則要視所持有的基金形態不同而有區別：封閉型基金有壹定的期限、期滿後，投資者可按待有的份額分得相應的剩余資產。在封閉期內還可以在交易市場上變現；開放型基金壹般沒有期限，但投資者可隨時向基金管理人要求贖回。