房屋維修基金發票丟失，也不會影響辦理房產證的。
1.辦理房產證所需提供的資料當中，維修基金不是必須提供的要件；
2.房屋維修基金是物業公司代收的，用於物業***用部位、公用設施及設備的更新、改造等項目，不是辦理房產證的必要資料，沒交房屋維修基金也可以辦理房產證的；
3.按照建設部、財政部聯合出臺165號令《住宅專項維修資金管理辦法》規定，公***維修金是由全體業主繳納的，屬全體業主***同所有；
4.壹般情況下由房地產行政主管機關來代管，業主委員會成立之後，公***維修金就會劃轉到業委會，由業委會行使管理權利。
房產證辦理流程是：
（1）買賣雙方進行房產交易後壹個月內持房屋買賣合同和其他證件到房地產交易所辦理買賣過戶登記。去辦理登記需要攜帶身份證、戶口本、《商品房銷售合同》等證件和資料。
（2）買賣雙方接到交易所辦理過戶手續的通知後，應攜帶身份證、戶口本、圖章等，在交納了手續費、契稅、印花稅後就可以辦理過戶手續。交易所會給買方發放房產賣契，原則上房產證需買賣雙方***同辦理。買賣雙方或壹方因故不能辦理買賣過戶手續和產權登記的，可出具委托書委托代理人代為辦理。
（3）辦理完買賣過戶手續後，買方應持房地產交易所發給的房產賣契，在三個月內到房屋所在地的市或區（縣）的房屋。
法律依據：
《住宅專項維修資金管理辦法》
第七條 商品住宅的業主、非住宅的業主按照所擁有物業的建築面積交存住宅專項維修資金，每平方米建築面積交存首期住宅專項維修資金的數額為當地住宅建築安裝工程每平方米造價的5%至8%。