1.投資主體不同。壹般資本市場的投資主體包括社會公眾和各類機構投資者；風險資本市場的投資主體則主要是保險基金、退休基金等長期效益類機構投資者和少數富有家庭。根據美國1997年的統計（Berlin，1998），風險資本中有54%來自退休基金和養老基金，30%來自各種基金和保險公司等，7%來自私人投資者。在風險資本二級市場上，對於己上市的中小高新技術企業股票，政府壹般也只鼓勵機構投資者和有相當資金量的個人投資者參與買賣，借以控制風險。
2.市場主體不同。普通資本市場的主體是發展成熟、規模較大、有壹定良好業績記錄的公司；風險資本市場的主體則是風險企業尤其是新生中小型高新技術公司，其經營穩定性低、規模較小，但有壹定增長潛力。
3.組織管理方式不同。投資於壹般資本市場的資金，有個人管理的、有基金公司管理的、有銀行管理的、有壹般公司管理的等等，呈多樣化特點。而風險資本的組織管理形式主要有兩種：壹是有限合夥制（Limited Partnership），即由投資者（有限合夥人）和資金管理者（壹般合夥人）合夥組成獨立的有限合夥企業，投資者出資並對合夥企業負有限責任，管理人在董事會的監督下負責風險投資的具體運作並對合夥企業負無限責任。在美國和英國，相當部分的風險資本是依據《有限合夥企業法》設立的。二是公司制，即風險資本以股份公司或有限責任公司的形式設立。公司制又可分為外部和內部兩種組織形式，外部形式是大公司或機構與風險資本家合作，提供資本讓風險資本家進行投資的組織形式；內部形式是大公司內部設立風險資本以鼓勵企業內部的創新。
4.股東作用不同。在壹般資本市場上，股權的分布是相對分散的，股東對公司的管理監督是被動間接的，主要通過投票選舉董事會、授權董事會、確定獨立的非執行董事等內部機制和市場對公司的外部監督機制來實現。而在風險資本市場上，股權的分布相對集中，風險資本家對所投資公司時管理監督是主動直接的，不僅直接參與公司重大決策的制定，而且還投入大量精力參與公司的經營管理，直接幫助企業運作發展，直到公司購並或上市、風險資本退出為止。
5.投資對象不同。從投資對象看，壹般資本市場的投資對象是相對分散的，對象的選擇取決於其盈利性。而風險資本市場的投資對象則通常是可重置度低或高度專業化的資產。依據其投資對象的不同，形成了從事計算機軟件、生物制藥、新材料、通信技術等高新技術產業的專業風險資本。這些風險資本在世界範圍內各自的專業領域中尋求投資對象。
6.投資方式不向。壹般資本市場上的投資主要是壹次性的，投資周期較短，其股份的流動性較強。而風險資本市場的投資則通常是多階段的。根據公司成長的狀況，不斷追加擴張所需的資本。風險資本是壹種長期資本，其投資周期壹般在3－7年之間，其股份的流動性也較差。從投資評估方法看，壹般資本市場與風險資本市場也存在本質差別。壹般資本市場的投資評估主要依據建立在現金流分析基礎上的傳統公司財務理論；而風險資本市場的投資評估則重視敏感性分析，采用期權定價等現代金融理論。
7.投資收獲方式不同。壹般資本市場的投資主要是通過分紅派息和股份增值來收獲的；風險資本則壹般不以企業分紅為目的，而是在退出時以股份增值作為報酬。風險資本的退出時間壹般選擇在企業上市或出售時。
8.二級市場的上市標準和監管理念不同。普通資本市場的上市標準較高，而風險資本市場的上市標準相對較低。例如，美國的納斯達克市場分為全國市場和小盤股市場，前者是壹般資本市場，後者則是以新興公司為主體的風險資本市場，前者在上市標準上顯著高於後者。從市場監管理念上看，壹般資本市場既強調充分的信息披露，也強調發行人的經營業績，以保護投資者的利益；而風險資本市場則主要強調信息披露基礎上的投資者自我保護，即重點在於上市公司信息的充分披露，而不在於公司的經營狀況。