(壹)特殊疾病住院和門診治療的結算程序
定點醫療機構應於每月10日前，將上月出院患者的費用清單、住院清單及相關資料上報醫療保險經辦機構，經審核後作為每月預撥和年終決算的依據。醫保經辦機構預撥上月特殊疾病住院和門診統籌費用。
參保人員經鑒定患有特殊疾病的，應當到勞動保障部門指定的定點醫療機構就醫、購藥，發生的醫療費用直接入賬，即時結算。
(2)緊急結算程序
參保人員因急診搶救到本市非定點醫療機構和異地醫療機構發生的醫療費用，由個人或單位先行墊付。急診搶救結束後，醫療保險經辦機構應當憑急診住院病歷、檢驗、化驗單、發票和醫療費用明細清單按規定辦理報銷手續。
(三)異地安置人員的安置手續
1.異地安置人員由所在單位指定為1-2的定點醫療機構，並報醫療保險經辦機構備案。
2.異地工作人員患病在居住地定點醫療機構門診發生的醫療費用，由本人或所在單位先行支付。治療結束後，所在單位應持參保人員的診斷書、病歷和有效費用。
使用票據、復方處方、住院費用清單等。在規定日期到社會醫療保險經辦機構結算。
法律依據:《中華人民共和國社會保險法》第二十八條符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準和急診、搶救醫療費用，按照國家規定從基本醫療保險基金中支付。
根據我國基本醫療保險待遇支付的基本要求，參保人到醫療保險機構報銷其本人就醫發生的醫療費用，壹般符合以下條件:
(1)參保人員就醫購藥必須到基本醫療保險定點醫療機構，或憑定點醫院醫生開具的醫療處方到社會保險機構確定的定點零售藥店購藥。
(2)參保人員在就診過程中發生的醫療費用，必須符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準的範圍和支付標準，做到按規定由基本醫療保險基金支付。
(三)參保人員符合基本醫療保險支付範圍的醫療費用中，高於社會醫療統籌基金起付標準、低於最高支付限額的部分，由社會醫療統籌基金統壹比例支付。