辦公室
協助秘書長協調和處理政務工作和日常工作；
擬定工作部署、工作計劃和總結，制定基金會各項工作制度；
負責辦理基金會法人登記、章程修改、年檢統計工作；
負責重要會議和大型活動的組織、協調工作；
負責文電處理、秘書事務、檔案管理、機要保密、安全保衛、信息、信訪工作；
負責人事、外事、黨務工作；
承辦秘書長交辦的其他事項。
財務部
負責基金會資產、財務的管理工作；
負責財務收支和會計核算，填報各項會計統計報表工作；
負責管理會計憑證和帳冊，以及立卷歸檔工作；
負責基金會的保值增值；
負責各項資助計劃方案制定和實施工作；
承辦基金會領導交辦的其它工作任務。
運動員保障部
負責優秀運動員保障工作的調研、政策研究和工作方案設計，以及建立保障體系的相關工作；
負責運動員保障專項資金工作；
負責運動員傷殘互助保險的實施工作；
負責國家隊老運動員、老教練員關懷基金的實施工作；
負責部分老運動員、老教練員特殊醫療照顧的實施工作。
其他有關運動員保障工作；
承辦基金會領導交辦的其它工作任務。
宣傳推廣部
負責基金會宣傳推廣工作的落實；
負責策劃、組織、實施基金會的體育公益慈善宣傳和基金募集工作；
負責運動員委員會的日常工作；
負責本部門各項規章制度和工作計劃的制定；
負責捐贈人、捐贈單位、新聞媒體等公***關系工作；
承辦基金會領導交辦的其它工作任務。
基金管理部
負責了解、掌握國家有關基金管理的方針、政策；
按國家有關法規、政策建立基金和管理基金；
負責基金保值增值方案的制定工作；
負責專項基金的日常管理和基金募集工作；
負責專項基金使用方案的制定工作；
承辦基金會領導交辦的其它工作任務。
國有資產部
負責貫徹落實國家有關資產管理的相關規定；
負責對外投資和股權管理工作；
負責國有資產產權登記和變更事項；
負責管理企業的高層管理人員的聘用考核工作；
負責管理企業的財務監督工作；
負責辦理基金會管理企業的對外投資、資產變更等相關手續；
承辦基金會領導交辦的其它工作任務。