針對土地流轉後的補貼收益問題,《農村土地承包經營權流轉管理辦法》第七條規定,農村土地承包經營權流轉收益歸承包方所有,任何組織和個人不得侵占、截留、扣繳。
就是說：誰種糧，補貼誰。
另外財政部、農業部最新公布的《關於調整完善農業三項補貼政策的指導意見》決定，自2015年起將各地從中央財政提前下達的農資綜合補貼中調整20%的資金，加上補貼種糧大戶試點的資金和農業“三項補貼”增量資金，統籌用於支持糧食適度規模經營。這筆資金將重點補貼種糧大戶、家庭農場、農民合作社、農業社會化服務組織等新型經營主體，即“誰多種糧食，就優先支持誰”。
2015年國家農業三項補貼
1、糧食直補
全稱糧食直接補貼，應遵循誰種地補給誰的原則，糧食主產省、自治區原則上按種糧農戶的實際種植面積進行補貼，承包地轉包給他人的，按承包協議處理。發放方式為直接現金發放或發放於農民“壹卡通 ”或“壹折通” 儲蓄存折或儲蓄卡中。
2、良種補貼
是指國家為支持農民積極使用優良種子，對生產中使用優質農作物良種的農民給予的補貼。農戶到良種補貼定點銷售部門購種，可持身份證及種子定點銷售部門開具的專用憑證，到鄉鎮財政所領取其補貼。
3、農資綜合補貼
是指政府對農民購買農業生產資料(包括化肥、柴油、種子、農機)實行的壹種直接補貼制度。通過農資綜合直補及各種補貼，來保證農民種糧收益的相對穩定，補貼資金通常來源於糧食風險基金，通過糧食風險基金專戶下撥。