北京大學校友會的歷史最早可以追溯到1919年，也就是在京師大學堂成立21年，京師大學堂改稱北京大學後7年，以萬兆芷（zhi）為會長的“北京大學留美同學會”在紐約成立，以“增進同學友誼，交換專門知識”為宗旨。這是北大的第壹個校友組織，是北大校友會發展史的源頭。上世紀20年代，北大校友組織是從美國、從歐洲延伸到上海、北京、南京等地，此時期的北大校友活動相當活躍，但是處在自發零散的狀態，組織不健全，規模不大且力量分散，對校友的服務能力也有限。建國以後到改革開放前後的30多年中，校友會在很長壹段時間內處於沈寂之中。
1984年5月4日，北京大學校友會作為正式的全國性的獨立社團組織成立了。1992年北京大學校友會正式在民政部註冊，成為獨立社團法人。1999年北京大學百年校慶之後，校友會成立了常設的秘書機構，在北京大學教育基金會下設校友工作部。21世紀以來，學校把校友工作擺在更加突出的位置，充分利用學校資源，不斷加強與廣大校友的聯系，竭誠為校友事業發展提供更多、更大的支持。
2010年10月，在第七屆理事會的大力推動下，學校審時度勢，組建了獨立的校友工作辦公室，與北京大學校友會秘書處合署辦公，既是北京大學正處級職能部門，又是獨立社團法人的秘書機構，為北京大學校友會在新時期的快速發展註入了全新的活力，北京大學校友工作打開了全新的局面。 北京大學校友會的業務範圍包括：
(壹) 加強校友間、校友和母校的聯系和情況交流；
(二) 促進校友為國家建設和母校的發展作貢獻；
(三) 進行學術交流；
(四) 組織聯誼活動；
(五) 編輯、印刷《校友通訊》等內部刊物。 北京大學校友會組織機構圖