基金的投資目標不同，其投資範圍、操作策略及其所受的投資約束也就不同。例如，債券型基金與股票型基金由於投資對象不同，在基金績效衡量上就不具有可比性。再例如，壹個僅可以進行小型股投資的基金經理與壹個僅投資於大型公司的基金經理也不具有可比性。因此在績效比較中必須註意投資目標對基金績效衡量可比性所造成的影響。
(二)基金的風險水平
現代投資理論表明，投資收益是由投資風險驅動的，因此投資組合的風險水平深深地影響著組合的投資表現，表現較好的基金可能僅僅是由於其所承擔的風險較高所致。因此為了對不同風險水平基金的投資表現做出恰當的考察，必須考察該基金所獲得的收益是否足以彌補其所承擔的風險水平，即需要在風險調整的基礎上對基金的績效加以衡量。
(三)比較基準
從成熟市場看，大多數基金經理人傾向於專註於某壹特定的投資風格，而不同投資風格的基金可能受市場周期性因素的影響而在不同階段表現出不同的群體特征，因此在基金的相對比較上，必須註意比較基準的合理選擇。
(四)時期選擇
在基金績效比較中，計算的開始時間和所選擇的計算時期不同，衡量結果也就不同。壹些公司常常會挑選對自己有利的計算時期進行業績的發布，因此必須註意時期選擇對績效評價可能造成的偏誤。
(五)基金組合的穩定性
基金操作策略的改變、資產配置比例的重新設置、經理的更換等都會影響到基金組合的穩定性。因此，在實際評價中必須對這些問題加以考慮。