文物收藏
住在寺院裏的僧人，修習禪學，傳播佛法，造福學生，是他們的重要任務。南普陀寺自1985恢復叢林管理制度後，在住持苗湛主持下，重新整理了規章制度。全寺200多名居民和僧人都能自覺遵守叢林戒律儀。他們除了每日早晚的誦經打坐外，還設立了各種定期或不定期的普立法會，如創設佛經普及講座和流通處，組織慈善基金會，舉辦各種慈善公益事業等。
大學燈籠
從1925年建校到1937年停辦的十年間，閩南佛學院曾由中國當代佛教領袖太虛大師擔任校長，並以此作為他改革中國僧侶教育的實驗園，成為享譽海內外的佛教高等學府，培養了壹批傑出的佛教人才。這些至今仍健在的僧人，大多已成為名山長老或佛教大師。如海內外著名的經學大師尹順長老、馬來西亞佛教協會前會長朱墨大師等都出自該院。1985年，學院正式重新開放。在住持苗湛的主持下，學院的教育設施、教學質量乃至規模都得到了很大的改善和發展，成為了全國僧人教育的重點學院。重新開學後，學院分為男、女兩個系。女子學院設在萬石蓮寺(今金榜山紫竹林寺)。兩個系有預科和本科兩個班，有來自21個省市的250多名男女僧人。到1992年，三局畢業的男女僧人共有194人，他們到各地主持寺院或擔任牧師。他們中的壹些人在佛教學院教書或在佛教協會服務。
供需惠及大眾
南普陀寺原是海內外佛教信徒朝拜的聖地，也發展成為中外遊客的去處。
旅遊熱點。在成千上萬的遊客中，有許多是訪問中國的歐美國家的貴賓，包括國際名人和友好國家的領導人，如英國前首相撒切爾夫人和日本駐華大使吉田。在參觀過程中，他們不僅表達了對莊嚴的寺院和美麗風景的喜愛，還深切感受到了中國政府宗教政策帶來的繁榮景象。為了滿足旅遊觀光和信徒活動的需要，寺內設置了購物部、照相部、茶室等各種服務設施。南普陀寺的素食餐廳是國內外最受歡迎的餐廳之壹。南普陀寺的素菜以其清純淡雅的獨特風味聞名中外。餐廳名廚準備菜品，嚴格遵守素菜的工藝，尤其是要改掉模仿素菜名稱的弊端，堅持素菜名稱獨樹壹幟。當代詩人郭沫若的《半月沈江》和趙樸初居士所贈的《於斯蘑菇雲》更是形與名俱雅，芳香適宜，耐人品人品與賞曲，雅趣無窮。為文人所欣賞。
藝術和文學收藏
南普陀寺的大殿、庭院、門廊等柱子上，都有文人墨客寫的對聯。對聯中，或托景抒情，或以撣子開悟，巧作對聯，各有千秋。古今詩人留下的詩詞也不少，其中不乏佳作，不僅格調清新，意境高遠，還不時被賦予記錄事實的內涵，讓後人在詩詞中獲得證明歷史疑點的機會。比如宋滕翔，他在關於壹望無際的巖石的詩中，如實地反映了壹望無際的巖石下的大海和山中野廟的荒涼景象，反證了所謂中唐未全面開發綠島前，有人捐地五十余畝建廟的誤傳。再比如鷺島著名詩人遲仙芳，他與明末復興趙普寺的詩人兼僧人黨廣齊名。在《五老山》這首詩的開篇，他就指出了覺光法師用“十年古寺剩幾把灰”重修趙普寺的史實